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2025-07-15T07:06:16Z

Dbrucker: /* CentraXX */

{{DISPLAYTITLE:WIKI der interdisziplinären Biomaterial- und Datenbank Frankfurt (iBDF)}}
__NOTOC__
__HIDDENCAT__

=WIKI der interdisziplinären Biomaterial- und Datenbank Frankfurt (iBDF)=
==[[über die iBDF]]==
Die '''Interdisziplinäre Biobank und Datenbank Frankfurt (iBDF)''' organisiert die qualitätsgesicherte und datenschutzkonforme Erfassung und Lagerung verschiedener Biomaterialien und verteilt diese an positiv bewertete Forschungsprojekte. Damit stellt das iBDF eine Schlüsselkomponente an der Schnittstelle zwischen Grundlagen-, Translations- und klinischer Forschung dar.



==[https://redmine.ibdf-frankfurt.de/projects/ibdf-wiki/wiki/ CentraXX]==



==[[ProSkive Projektskizzenverwaltung|APProVe Projektskizzenverwaltung]]==
'''APProVe''' ist eine open source Softwarelösung zur Projektverfolgung bei der Beantragung von Biomaterialien und klinischen Daten an der UCT Biobank.

APProVe ist aus dem Internet erreichbar unter: '''https://approve.ibdf-frankfurt.de/'''

==[[Scientific Board des UCT]]==
'''Schnellzugriff:''' [https://www.uct-frankfurt.de/uct-biobank.html UCT-Projektskizzeneinreichung]

;'''Nächste Sitzungstermine (Einreichungsfrist):''' https://approve.ibdf-frankfurt.de/

__HIDETITLE__

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2025-07-15T07:05:54Z

Dbrucker: /* CentraXX */

{{DISPLAYTITLE:WIKI der interdisziplinären Biomaterial- und Datenbank Frankfurt (iBDF)}}
__NOTOC__
__HIDDENCAT__

=WIKI der interdisziplinären Biomaterial- und Datenbank Frankfurt (iBDF)=
==[[über die iBDF]]==
Die '''Interdisziplinäre Biobank und Datenbank Frankfurt (iBDF)''' organisiert die qualitätsgesicherte und datenschutzkonforme Erfassung und Lagerung verschiedener Biomaterialien und verteilt diese an positiv bewertete Forschungsprojekte. Damit stellt das iBDF eine Schlüsselkomponente an der Schnittstelle zwischen Grundlagen-, Translations- und klinischer Forschung dar.



==[[CentraXX]]==



==[[ProSkive Projektskizzenverwaltung|APProVe Projektskizzenverwaltung]]==
'''APProVe''' ist eine open source Softwarelösung zur Projektverfolgung bei der Beantragung von Biomaterialien und klinischen Daten an der UCT Biobank.

APProVe ist aus dem Internet erreichbar unter: '''https://approve.ibdf-frankfurt.de/'''

==[[Scientific Board des UCT]]==
'''Schnellzugriff:''' [https://www.uct-frankfurt.de/uct-biobank.html UCT-Projektskizzeneinreichung]

;'''Nächste Sitzungstermine (Einreichungsfrist):''' https://approve.ibdf-frankfurt.de/

__HIDETITLE__

Suche mit CentraXX

2022-08-26T09:57:43Z

Dbrucker: Screenshot in Tabelle überführt

zurück zum Hauptartikel [[CentraXX]]
==Grundlagen==

[[Datei:CentraXX_Patientensuche.jpg|upright|thumb|Die Patientensuche]]
Die '''Patientensuche''' wird über [Patient / Patientensuche gestartet]. Sie können sich die Patientensuche auch als Einstiegsseite in CentraXX in den Einstellungen hinterlegen.

===Suche mit Platzhaltern===
Grundsätzlich kann mit zwei '''Platzhaltern''' gesucht werden: 
'''*''': ersetzt beliebig viele Zeichen (z.B.: M*er findet Müller, Maier, Meier, ...) 
'''?''': ersetzt genau ein Zeichen (z.B.: M?ier findet Maier und Meier, nicht aber Müller) 

===Nummernkreise (Patienten ID)===
In CentraXX wird eine Vielzahl von Nummernkreisen eingesetzt. Diese bezeichnen einen Patienten oder eine Probe eindeutig. Jeder Patient (auch wenn er in CentraXX angelegt wurde) hat mindestens die eindeutige '''CentraXX-ID'''. Da CentraXX an verschiedenen Systemen angeschlossen ist, werden die identifizierenden Nummern aus diesen Systemen zusätzlich nach CentraXX übernommen. Ein am UCT dokumentierter Patient besitzt somit mindestens den '''MPI''' (Master Patient Index), dieser entspricht der '''PID''' in Orbis. Außerdem die '''GTDS-ID''', unter welcher der Patient in der Tumordokumentation geführt wird und die '''CentraXX-ID''' welcher der in CentraXX vergebene eindeutige Bezeichner ist. Das Zusammenführen eines Patienten in CentraXX aus den verschiedenen Systemen erfolgt anhand der PID von CentraXX automatisch. Diese und weitere IDs kann man in den Suchkriterien unter '''Patienten-ID''' auswählen. Patienten lassen sich auch über die '''Fallnummer''' suchen, welche in CentraXX '''Episoden ID''' genannt wird. Näheres dazu weiter unten bei den [[#Suchbeispiele|Suchbeispielen]].

===Erweiterte Suche=== 

[[Datei:Erweiterte Suche mit Klammern.jpg|thumb|left|Erweiterte Suche]]Über die "'''Erweiterte Suche'''" hat man die Möglichkeit nicht einzelne Patienten sondern '''Patientengruppen''' zu finden, die einer bestimmten '''Fragestellung''' entsprechen. Man hat dabei die Möglichkeit, die Suche als logische Suche mit Klammern aufzubauen:

*Über dem Eingabebereich der Suchabfrage wird im Feld "'''Suchkriterien'''" die Suchabfrage dargestellt. Dies dient insbesondere bei komplexen Abfragen mit Klammern und verschachtelten '''UND/ODER''' Bedingungen zur Kontrolle.
*Mit dem Plus [[Image:SYM_plus.png|without]] kann man das erste Kriterium hinzufügen.
*Das Plus mit Klammer [[image:SYM plus Klammer.png|without]] öffnet eine logische Klammer in der Suche. Diese wird durch einen umschließenden Kasten dargestellt.
*Die beiden Blätter [[Image: SYM_Duplizieren.png|without]] kopieren ein Suchkriterium in die nächste Zeile.
*Über den Papierkorb [[Image:SYM_Papierkorb.png|without]] kann man ein einzelnes Kriterium löschen.

Grundsätzlich können Bedingungen mit '''UND/ODER''' verknüpft werden. Außerdem können alle Bedingungen über die Auswahlbox vor dem Wertefeld mit '''"ungleich" verneint''' werden.

Über '''"Suchen"''' startet die Suche. Diese ist je nach Umfang nach wenigen Sekunden abgeschlossen.

Mit '''"Suche laden"''' kann eine selbst gespeicherte oder zentral zur Verfügung gestellte Suche geladen oder gelöscht werden. Außerdem gibt es in dem dann geöffneten Fenster die Möglichkeit, eigene Suchen anderen Benutzern oder gesamten Organisationseinheiten mit dem Symbol [[Image:SYM_Freigabe.png|without]] freizugeben. Die von '''anderen Benutzern zur Verfügung gestellten Suchen''' finden sich im unteren Bereich des Fensters.

Mit '''"Suche speichern"''' kann man selbst erstellte Suchen speichern. Falls Sie diese später anderen Benutzern zur Verfügung stellen möchten,kann man dies über '''"Suche laden"''' tun.

===Gestalten einer Suche mit mehreren Bedingungen===
Falls Sie mehrere Suchen miteinander verknüpfen müssen Sie beachten, dass die Reihenfolge der Suchbedingungen eine Rolle spielt. Dies gilt insbesondere bei Kombination mehrerer UND/ODER-Bedingungen. Eine Suche wird '''von "oben" nach "unten"''' abgearbeitet. Dabei werden gesetzte Klammern berücksichtigt. Sie müssen sich beim Entwurf der Suche bereits überlegen, welche Bedingungen sie miteinander in welcher Reihenfolge kombinieren, um zum gewünschten Ergebnis zu kommen.

===Wichtige Kriteriengruppen===
Die wichtigsten Kriteriengruppen für den Anfang sind folgende:

:'''ICD Codierung''': Hier kann die ICD-10, welche in der Tumordokumentation zum Patienten abgelegt ist, abgefragt werden
:'''Patient''': umfasst alle Stammdaten des Patienten (z.B. Alter, Geschlecht etc.)
:'''Probe''': Über [Probe – Probentyp – Flüssig/Gewebeprobe] kann auf das Vorhandensein einer Probe zum Patienten gesucht werden.
:'''Suchkatalog''': Der Suchkatalog erleichtert die Suche nach bestimmten Tumorerkrankungen, da die '''Kodierung bereits hinterlegt''' ist.
:'''Messwert (Befund)''': Mithilfe von Messbefunden können alle Merkmale, die über die Standard-Dokumentation hinausgehen (z.B. molekulare Marker oder Blutwerte), abgefragt werden.

==Suche mit dem Suchkatalog==

Da die korrekte Abfrage von Krankheiten mittels ICD-10 und ICD-O-3 oftmals eine Herausforderung darstellt, wurde in CentraXX die Möglichkeit implementiert, die wichtigsten Tumorentitäten auswählen zu können und ohne Angabe eines ICDs in der Applikation abzufragen. CentraXX erstellt mit Hilfe eines hinterlegten Katalogs dann die zutreffende SQL-Abfrage aus ICD-10 und ICD-O-3 zusammen und führt diese aus.

===Beispiel===

Alle Patienten, die ein '''Soft-Tissue-Ewing-Sarkom''' besitzen und '''über 18 Jahre''' alt sind.

Eine '''manuelle Abfrage''' müsste über folgende Entitäten als ODER-Suche mit einer UND-Suche über das Alter verknüpft werden:

{| class="wikitable"
! colspan="2" align="center" |ODER
!UND
!
|-
!ICD-10!!ICD-O-3 M!!Alter
!
|-
|C25.*|| rowspan="8" align="center" | 9260-3, 9473-3
| rowspan="8" align="center" |18
| rowspan="8" |[[Image:Manuell Ewing-Soft-Sissue-Sarkom.png|thumb|upright=1.9|Manuelle Suchabfrage nach Ewing-Soft-Tissue-Sarkom|alternativtext=]]
|-
|C30.*
|-
|C31.*
|-
|C49.*
|-
|C51.*
|-
|C52
|-
|C71.*
|-
|C72.*
|}

'''Einfacher''' kann diese Abfrage über den '''Suchkatalog''' wie folgt abgebildet werden:

[Suchkatalog | Sarkome | Ewing-Sarkom: Soft Tissue Ewing Sarkom] '''UND''' [Patient | Alter | >18]
 
[[Image:Suchkatalog Ewing-Soft-Sissue-Sarkom.png|left|thumb|upright=1.9|Beispiel im Suchkatalog]]

 

==Suchergebnisse==
[[Datei:CentraXX Bsp C20 Probe erg.jpg|thumb|Ergebnis der Suche nach C20+Biomaterial]]
Die durch die Suche gewonnenen Ergebnisse dienen der Erleichterung der Planung eines Projektes. Es sollen damit keinesfalls Daten für ein wissenschaftliches Projekt im Rahmen einer Auswertung umgesetzt werden. '''Falls sich aus dem Suchergebnis ein Projekt generieren lässt, so soll dies als Projektskizze im [[Scientific_Board_des_UCT|Scientific Board]] des UCT eingereicht werden'''. Nur so erhalten Sie das notwendige '''Ethikvotum''' für die Verwendung der Daten.

Das Ergebnis teilt sich in zwei Hälften auf: in der '''oberen Hälfte''' werden Patienten angezeigt, die in einem '''Behandlungszusammenhang''' stehen. In der '''unteren Hälfte''' erscheinen alle anderen dokumentierten Tumorpatienten des UKF in '''pseudonymisierter Form'''.

===Spalten der Ergebnisliste===
Es gibt die Möglichkeit, die vorhandenen Spalten durch Weitere zu ergänzen, indem man den kleinen Dropdown-Pfeil ganz rechts in der Spaltenübersicht des Suchergebnisses drückt. Einige Spalten (mit dem a-z-Symbol) können außerdem sortiert werden. Zudem kann man die Spaltenbreite wie bei Excel verändern. In den persönlichen Einstellungen kann man außerdem die Standardansicht festlegen und '''zusätzliche Spalten''' dauerhaft anwählen.

===Verfeinern eines Suchergebnisses durch eine Suche auf das Ergebnis===
Es ist möglich, '''das Suchergebnis zu verfeinern''', also eine Suche auf das gewonnene Ergebnis anzuwenden. Dabei wird im Suchergebnis bei den Suchkriterien die Option '''Suchergebnis verfeinern''' ausgewählt. Daraufhin öffnet sich eine weitere "Erweiterte Suche", welche aber '''ausschließlich auf das Suchergebnis''' angewandt wird.

[[Datei:Suchergebnis_verfeinern.png|alternativtext=|800x800px]]

==Suchbeispiele==
===Suche nach Fallnummern===
Neben der '''Patienten-ID (PID/MPI)''' kann auch nach der '''Fallnummer''' gesucht werden. Diese wird in CentraXX als '''"Episoden ID"''' oder '''"externe Episoden ID"''' bezeichnet. Sie sollte auf keinen Fall mit der '''"CentraXX-Episoden ID"''' verwechselt werden. Hiezu muss in der '''erweiterten Patientensuche''' nach [Episode | Episoden ID | ...] abgefragt werden.

===Suche mit ICD-10-Codes ===
Die in ICD-10 verschlüsselte '''Erkrankung''' kann in der '''Erweiterten Patientensuche''' über [ICD-Code | ICD-10 Code | ...] abgefragt werden. Bei der Nutzung von ICD-Codes ist darauf zu achten, dass diese '''häufig mit Nachkommastellen''' codiert sind. Deswegen ist es ratsam, die '''ICD-Codes mit einem "*" abzuschließen''', außer man möchte ganz spezifisch nach einem ICD-Code suchen.

Beispiel: '''C92.* statt C92'''

===Suche nach Erstdiagnosen===
Um Patienten mit '''Erstdiagnose''' aus einem bestimmten Jahr abfragen zu können, kann in der '''Erweiterten Patientensuche''' über [Tumor | Diagnosedatum | ...] das Erstdiagnosedatum eingeschränkt werden. Falls der Patient mehrere Tumoren besitzt, sind mehrere Erstdiagnosedaten möglich.

=== Stadienspezifische Suche (TNM)===
Die Suche nach TNM-Stadium ist vor allem in der Dermatologie komplizierter, da hier die Stadieneinteilung nicht nur I, II, III, IV umfasst sondern '''auch die Untergruppen a und b'''. Außerdem werden Studien in Römischen Ziffern codiert, was die Suche etwas erschwert. Dies hat folgendes Vorgehen zur Folge:

Eine Suche nach Stadium IIa und IIb lautet wie folgt:

[TNM | Stadium | II?] '''UND NICHT''' [TNM | Stadium | III]

da sonst Stadium IIa, IIb '''und''' III gefunden werden.

===Suche nach Histo-Grading===
Das Histologische Grading in CentraXX speist sich aus einem in GTDS geführten Katalog. Dieser hat momentan folgende Ausprägungen:
'''Umsetzung der Grading-Suche in CentraXX'''
{| class="wikitable"

!Grading aus GTDS!!Eingabe in CentraXX
|-
|0||0
|-
|B||B
|-
|B-Zellig||B-* (nicht 'B*'!)
|-
|G||G (nicht 'G*'!)
|-
|G1 (Gut differenziert)||G1*
|-
|G2 (Mäßig differenziert)||G2*
|-
|G3 (Schlecht differenziert)||G3*
|-
|G4 (Undifferenziert)||G4*
|-
|GX (Differenzierungsgrad oder Herkunft nicht zu bestimmen)||GX*
|-
|H||H
|-
|Is||Is
|-
|L||L
|-
|Low grade (G1/G2)||Low*
|-
|M||M
|-
|T|| T
|-
|X||X
|}

Um das Grading G1-G4 abfragen zu können, muss somit '''G1*, G2*, G3* oder G4*''' bei einer Abfrage eingegeben werden. Ansonsten wird das Grading aufgrund der in der folgenden Klammer vermerkten Ausprägung nicht gefunden.

===Suche nach sonstigen Klassifikationen===
Weitere Klassifikationen wie z.B. das FIGO-Stadium werde wie folgt gesucht:

[Sonstige Klassifikation | Name | "FIGO*"]

Um dies mit einem Grading zu kombinieren, als UND-Suche anschließen:

[Sonstige Klassifikation | Stadium | "III"]

===Suche nach Messwerten ===

Messbefunde ermöglichen die unkomplizierte Dokumentation von klinischen und wissenschaftlichen Merkmalen an Proben oder Patienten, welche über die ADT-Standarddokumentation hinaus gehen. Hierzu gehören z.B. die sogenannten '''"erweiterten Merkmale"''' aus der Tumordokumentation als auch z.B. '''Laborwerte''' aus dem Zentrallabor.
<gallery>
Messbefund-1.png| 1) Öffnen des Messwert-Dialogs mit dem [+]
Messbefund-2.png| 2) Auswahl des Befundtyps (Tumor-/Episoden-/Probenbefund)
Messbefund-3.png| 3) Auswahl der Messprofils (GTDS für Tumorbefunde)
Messbefund-4.png| 4) Auswahl des Messparameters
Messbefund-5.png| 3a)Auswahl des Messprofils SWISSLAB
</gallery>

===Suche nach einem Patienten mit Rektumkarzinom und asserviertem Biomaterial===

[ICD Codierung | ICD-10 Code | C20] '''UND''' [Probe | Probentyp | Gewebeprobe]

[[Datei:CentraXX Bsp C20 Probe.jpg|left|thumb|without|upright=1.9|Beispiel einer Suche nach C20]]
 

===Suche nach Histologie (ICD-O-3-M)===
In CentraXX kann neben der ICD-10-Codierung auch nach der '''Histologie''' eines Tumors gesucht werden. Diese wird in der ICD-O-3 codiert. Dabei ist Folgendes unbedingt zu beachten: '''Histologie-Codes''' der ICD-O-3-M werden normalerweise in 4 Stellen und einem folgenden Bindestrich mit einer weiteren Ziffer abgebildet, die die Malignität abbildet. '''In CentraXX fällt der Bindestrich weg!'''

'''Umsetzung der Histologie-Suche in CentraXX'''
{| class="wikitable"

!ICD-O-3-M!!Eingabe in CentraXX
|-
|9260-3||92603
|-
|9473-3||94733
|}

===Suche nach einer Systemtherapie ===
In CentraXX kann neben dem Protokoll (z.B. Mono-Chemotherapie, Poly-Chemotherapie, Hormontherapie etc.) auch nach der Intention, dem Status nach Therapieende, den Nebenwirkungen und Anderem abgefragt werden. Häufig sind die Verwendeten Substanzen von besonderem Interesse.
'''Beispiel:''' Um nach einem Patienten mit Carboplatin/Etoposid zu suchen, muss folgende Suche in der Erweiterten Suche definiert werden:

[Systemtherapie | Beschreibung | gleich | '''*Carboplatin*'''] UND [Systemtherapie | Beschreibung | gleich | '''*Etoposid*''']

'''Wichtig sind hier wieder die Platzhalter (*), ohne die eine Suche nur zu unvollständigen Ergebnissen führen würde.'''

===Abfrage des Vitalstatus===
Häufig stellt sich die Frage, ob Patienten noch leben oder bereits verstorben sind. Dies kann man über die Erweiterte Suche wie folgt abfragen:

Patient '''lebt noch''': [Patient | Sterbedatum | '''leer''']

Patient '''verstorben''': [Patient | Sterbedatum | '''beliebig'''] oder [Patient | Sterbedatum | '''von-bis''']
[[Datei:Vitalstatussuche.png|left|thumb|without|upright=2.5|Beispiel einer Vitalstatusabfrage]]
[[Category:CentraXX]]

Suche mit CentraXX

2022-08-26T07:44:21Z

Dbrucker:

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==Grundlagen==

[[Datei:CentraXX_Patientensuche.jpg|upright|thumb|Die Patientensuche]]
Die '''Patientensuche''' wird über [Patient / Patientensuche gestartet]. Sie können sich die Patientensuche auch als Einstiegsseite in CentraXX in den Einstellungen hinterlegen.

===Suche mit Platzhaltern===
Grundsätzlich kann mit zwei '''Platzhaltern''' gesucht werden: 
'''*''': ersetzt beliebig viele Zeichen (z.B.: M*er findet Müller, Maier, Meier, ...) 
'''?''': ersetzt genau ein Zeichen (z.B.: M?ier findet Maier und Meier, nicht aber Müller) 

===Nummernkreise (Patienten ID)===
In CentraXX wird eine Vielzahl von Nummernkreisen eingesetzt. Diese bezeichnen einen Patienten oder eine Probe eindeutig. Jeder Patient (auch wenn er in CentraXX angelegt wurde) hat mindestens die eindeutige '''CentraXX-ID'''. Da CentraXX an verschiedenen Systemen angeschlossen ist, werden die identifizierenden Nummern aus diesen Systemen zusätzlich nach CentraXX übernommen. Ein am UCT dokumentierter Patient besitzt somit mindestens den '''MPI''' (Master Patient Index), dieser entspricht der '''PID''' in Orbis. Außerdem die '''GTDS-ID''', unter welcher der Patient in der Tumordokumentation geführt wird und die '''CentraXX-ID''' welcher der in CentraXX vergebene eindeutige Bezeichner ist. Das Zusammenführen eines Patienten in CentraXX aus den verschiedenen Systemen erfolgt anhand der PID von CentraXX automatisch. Diese und weitere IDs kann man in den Suchkriterien unter '''Patienten-ID''' auswählen. Patienten lassen sich auch über die '''Fallnummer''' suchen, welche in CentraXX '''Episoden ID''' genannt wird. Näheres dazu weiter unten bei den [[#Suchbeispiele|Suchbeispielen]].

===Erweiterte Suche=== 

[[Datei:Erweiterte Suche mit Klammern.jpg|thumb|left|Erweiterte Suche]]Über die "'''Erweiterte Suche'''" hat man die Möglichkeit nicht einzelne Patienten sondern '''Patientengruppen''' zu finden, die einer bestimmten '''Fragestellung''' entsprechen. Man hat dabei die Möglichkeit, die Suche als logische Suche mit Klammern aufzubauen:

*Über dem Eingabebereich der Suchabfrage wird im Feld "'''Suchkriterien'''" die Suchabfrage dargestellt. Dies dient insbesondere bei komplexen Abfragen mit Klammern und verschachtelten '''UND/ODER''' Bedingungen zur Kontrolle.
*Mit dem Plus [[Image:SYM_plus.png|without]] kann man das erste Kriterium hinzufügen.
*Das Plus mit Klammer [[image:SYM plus Klammer.png|without]] öffnet eine logische Klammer in der Suche. Diese wird durch einen umschließenden Kasten dargestellt.
*Die beiden Blätter [[Image: SYM_Duplizieren.png|without]] kopieren ein Suchkriterium in die nächste Zeile.
*Über den Papierkorb [[Image:SYM_Papierkorb.png|without]] kann man ein einzelnes Kriterium löschen.

Grundsätzlich können Bedingungen mit '''UND/ODER''' verknüpft werden. Außerdem können alle Bedingungen über die Auswahlbox vor dem Wertefeld mit '''"ungleich" verneint''' werden.

Über '''"Suchen"''' startet die Suche. Diese ist je nach Umfang nach wenigen Sekunden abgeschlossen.

Mit '''"Suche laden"''' kann eine selbst gespeicherte oder zentral zur Verfügung gestellte Suche geladen oder gelöscht werden. Außerdem gibt es in dem dann geöffneten Fenster die Möglichkeit, eigene Suchen anderen Benutzern oder gesamten Organisationseinheiten mit dem Symbol [[Image:SYM_Freigabe.png|without]] freizugeben. Die von '''anderen Benutzern zur Verfügung gestellten Suchen''' finden sich im unteren Bereich des Fensters.

Mit '''"Suche speichern"''' kann man selbst erstellte Suchen speichern. Falls Sie diese später anderen Benutzern zur Verfügung stellen möchten,kann man dies über '''"Suche laden"''' tun.

===Gestalten einer Suche mit mehreren Bedingungen===
Falls Sie mehrere Suchen miteinander verknüpfen müssen Sie beachten, dass die Reihenfolge der Suchbedingungen eine Rolle spielt. Dies gilt insbesondere bei Kombination mehrerer UND/ODER-Bedingungen. Eine Suche wird '''von "oben" nach "unten"''' abgearbeitet. Dabei werden gesetzte Klammern berücksichtigt. Sie müssen sich beim Entwurf der Suche bereits überlegen, welche Bedingungen sie miteinander in welcher Reihenfolge kombinieren, um zum gewünschten Ergebnis zu kommen.

===Wichtige Kriteriengruppen===
Die wichtigsten Kriteriengruppen für den Anfang sind folgende:

:'''ICD Codierung''': Hier kann die ICD-10, welche in der Tumordokumentation zum Patienten abgelegt ist, abgefragt werden
:'''Patient''': umfasst alle Stammdaten des Patienten (z.B. Alter, Geschlecht etc.)
:'''Probe''': Über [Probe – Probentyp – Flüssig/Gewebeprobe] kann auf das Vorhandensein einer Probe zum Patienten gesucht werden.
:'''Suchkatalog''': Der Suchkatalog erleichtert die Suche nach bestimmten Tumorerkrankungen, da die '''Kodierung bereits hinterlegt''' ist.
:'''Messwert (Befund)''': Mithilfe von Messbefunden können alle Merkmale, die über die Standard-Dokumentation hinausgehen (z.B. molekulare Marker oder Blutwerte), abgefragt werden.

==Suche mit dem Suchkatalog==

Da die korrekte Abfrage von Krankheiten mittels ICD-10 und ICD-O-3 oftmals eine Herausforderung darstellt, wurde in CentraXX die Möglichkeit implementiert, die wichtigsten Tumorentitäten auswählen zu können und ohne Angabe eines ICDs in der Applikation abzufragen. CentraXX erstellt mit Hilfe eines hinterlegten Katalogs dann die zutreffende SQL-Abfrage aus ICD-10 und ICD-O-3 zusammen und führt diese aus.

===Beispiel===

Alle Patienten, die ein '''Soft-Tissue-Ewing-Sarkom''' besitzen und '''über 18 Jahre''' alt sind.

Eine '''manuelle Abfrage''' müsste über folgende Entitäten als ODER-Suche mit einer UND-Suche über das Alter verknüpft werden:

[[Image:Manuell Ewing-Soft-Sissue-Sarkom.png|left|thumb|upright=1.9|Manuelle Suchabfrage nach Ewing-Soft-Tissue-Sarkom]]
{| class="wikitable"
! colspan="2" align="center" |ODER
!UND
|-
!ICD-10!!ICD-O-3 M!!Alter
|-
|C25.*|| rowspan="8" align="center" |9260-3, 9473-3
| rowspan="8" align="center" |18
|-
|C30.*
|-
|C31.*
|-
|C49.*
|-
|C51.*
|-
|C52
|-
|C71.*
|-
|C72.*
|}

'''Einfacher''' kann diese Abfrage über den '''Suchkatalog''' wie folgt abgebildet werden:

[Suchkatalog | Sarkome | Ewing-Sarkom: Soft Tissue Ewing Sarkom] '''UND''' [Patient | Alter | >18]
 
[[Image:Suchkatalog Ewing-Soft-Sissue-Sarkom.png|left|thumb|upright=1.9|Beispiel im Suchkatalog]]

 

==Suchergebnisse==
[[Datei:CentraXX Bsp C20 Probe erg.jpg|thumb|Ergebnis der Suche nach C20+Biomaterial]]
Die durch die Suche gewonnenen Ergebnisse dienen der Erleichterung der Planung eines Projektes. Es sollen damit keinesfalls Daten für ein wissenschaftliches Projekt im Rahmen einer Auswertung umgesetzt werden. '''Falls sich aus dem Suchergebnis ein Projekt generieren lässt, so soll dies als Projektskizze im [[Scientific_Board_des_UCT|Scientific Board]] des UCT eingereicht werden'''. Nur so erhalten Sie das notwendige '''Ethikvotum''' für die Verwendung der Daten.

Das Ergebnis teilt sich in zwei Hälften auf: in der '''oberen Hälfte''' werden Patienten angezeigt, die in einem '''Behandlungszusammenhang''' stehen. In der '''unteren Hälfte''' erscheinen alle anderen dokumentierten Tumorpatienten des UKF in '''pseudonymisierter Form'''.

===Spalten der Ergebnisliste===
Es gibt die Möglichkeit, die vorhandenen Spalten durch Weitere zu ergänzen, indem man den kleinen Dropdown-Pfeil ganz rechts in der Spaltenübersicht des Suchergebnisses drückt. Einige Spalten (mit dem a-z-Symbol) können außerdem sortiert werden. Zudem kann man die Spaltenbreite wie bei Excel verändern. In den persönlichen Einstellungen kann man außerdem die Standardansicht festlegen und '''zusätzliche Spalten''' dauerhaft anwählen.

===Verfeinern eines Suchergebnisses durch eine Suche auf das Ergebnis===
Es ist möglich, '''das Suchergebnis zu verfeinern''', also eine Suche auf das gewonnene Ergebnis anzuwenden. Dabei wird im Suchergebnis bei den Suchkriterien die Option '''Suchergebnis verfeinern''' ausgewählt. Daraufhin öffnet sich eine weitere "Erweiterte Suche", welche aber '''ausschließlich auf das Suchergebnis''' angewandt wird.

[[Datei:Suchergebnis_verfeinern.png|alternativtext=|800x800px]]

==Suchbeispiele==
===Suche nach Fallnummern===
Neben der '''Patienten-ID (PID/MPI)''' kann auch nach der '''Fallnummer''' gesucht werden. Diese wird in CentraXX als '''"Episoden ID"''' oder '''"externe Episoden ID"''' bezeichnet. Sie sollte auf keinen Fall mit der '''"CentraXX-Episoden ID"''' verwechselt werden. Hiezu muss in der '''erweiterten Patientensuche''' nach [Episode | Episoden ID | ...] abgefragt werden.

===Suche mit ICD-10-Codes===
Die in ICD-10 verschlüsselte '''Erkrankung''' kann in der '''Erweiterten Patientensuche''' über [ICD-Code | ICD-10 Code | ...] abgefragt werden. Bei der Nutzung von ICD-Codes ist darauf zu achten, dass diese '''häufig mit Nachkommastellen''' codiert sind. Deswegen ist es ratsam, die '''ICD-Codes mit einem "*" abzuschließen''', außer man möchte ganz spezifisch nach einem ICD-Code suchen.

Beispiel: '''C92.* statt C92'''

===Suche nach Erstdiagnosen===
Um Patienten mit '''Erstdiagnose''' aus einem bestimmten Jahr abfragen zu können, kann in der '''Erweiterten Patientensuche''' über [Tumor | Diagnosedatum | ...] das Erstdiagnosedatum eingeschränkt werden. Falls der Patient mehrere Tumoren besitzt, sind mehrere Erstdiagnosedaten möglich.

===Stadienspezifische Suche (TNM)===
Die Suche nach TNM-Stadium ist vor allem in der Dermatologie komplizierter, da hier die Stadieneinteilung nicht nur I, II, III, IV umfasst sondern '''auch die Untergruppen a und b'''. Außerdem werden Studien in Römischen Ziffern codiert, was die Suche etwas erschwert. Dies hat folgendes Vorgehen zur Folge:

Eine Suche nach Stadium IIa und IIb lautet wie folgt:

[TNM | Stadium | II?] '''UND NICHT''' [TNM | Stadium | III]

da sonst Stadium IIa, IIb '''und''' III gefunden werden.

===Suche nach Histo-Grading===
Das Histologische Grading in CentraXX speist sich aus einem in GTDS geführten Katalog. Dieser hat momentan folgende Ausprägungen:
'''Umsetzung der Grading-Suche in CentraXX'''
{| class="wikitable"

!Grading aus GTDS!!Eingabe in CentraXX
|-
|0||0
|-
|B||B
|-
|B-Zellig||B-* (nicht 'B*'!)
|-
|G||G (nicht 'G*'!)
|-
|G1 (Gut differenziert)||G1*
|-
|G2 (Mäßig differenziert)||G2*
|-
|G3 (Schlecht differenziert)||G3*
|-
|G4 (Undifferenziert)||G4*
|-
|GX (Differenzierungsgrad oder Herkunft nicht zu bestimmen)||GX*
|-
|H||H
|-
|Is||Is
|-
|L||L
|-
|Low grade (G1/G2)||Low*
|-
|M||M
|-
|T||T
|-
|X||X
|}

Um das Grading G1-G4 abfragen zu können, muss somit '''G1*, G2*, G3* oder G4*''' bei einer Abfrage eingegeben werden. Ansonsten wird das Grading aufgrund der in der folgenden Klammer vermerkten Ausprägung nicht gefunden.

===Suche nach sonstigen Klassifikationen===
Weitere Klassifikationen wie z.B. das FIGO-Stadium werde wie folgt gesucht:

[Sonstige Klassifikation | Name | "FIGO*"]

Um dies mit einem Grading zu kombinieren, als UND-Suche anschließen:

[Sonstige Klassifikation | Stadium | "III"]

===Suche nach Messwerten===

Messbefunde ermöglichen die unkomplizierte Dokumentation von klinischen und wissenschaftlichen Merkmalen an Proben oder Patienten, welche über die ADT-Standarddokumentation hinaus gehen. Hierzu gehören z.B. die sogenannten '''"erweiterten Merkmale"''' aus der Tumordokumentation als auch z.B. '''Laborwerte''' aus dem Zentrallabor.
<gallery>
Messbefund-1.png| 1) Öffnen des Messwert-Dialogs mit dem [+]
Messbefund-2.png| 2) Auswahl des Befundtyps (Tumor-/Episoden-/Probenbefund)
Messbefund-3.png| 3) Auswahl der Messprofils (GTDS für Tumorbefunde)
Messbefund-4.png| 4) Auswahl des Messparameters
Messbefund-5.png| 3a)Auswahl des Messprofils SWISSLAB
</gallery>

===Suche nach einem Patienten mit Rektumkarzinom und asserviertem Biomaterial===

[ICD Codierung | ICD-10 Code | C20] '''UND''' [Probe | Probentyp | Gewebeprobe]

[[Datei:CentraXX Bsp C20 Probe.jpg|left|thumb|without|upright=1.9|Beispiel einer Suche nach C20]]
 

===Suche nach Histologie (ICD-O-3-M)===
In CentraXX kann neben der ICD-10-Codierung auch nach der '''Histologie''' eines Tumors gesucht werden. Diese wird in der ICD-O-3 codiert. Dabei ist Folgendes unbedingt zu beachten: '''Histologie-Codes''' der ICD-O-3-M werden normalerweise in 4 Stellen und einem folgenden Bindestrich mit einer weiteren Ziffer abgebildet, die die Malignität abbildet. '''In CentraXX fällt der Bindestrich weg!'''

'''Umsetzung der Histologie-Suche in CentraXX'''
{| class="wikitable"

!ICD-O-3-M!!Eingabe in CentraXX
|-
|9260-3||92603
|-
|9473-3||94733
|}

===Suche nach einer Systemtherapie===
In CentraXX kann neben dem Protokoll (z.B. Mono-Chemotherapie, Poly-Chemotherapie, Hormontherapie etc.) auch nach der Intention, dem Status nach Therapieende, den Nebenwirkungen und Anderem abgefragt werden. Häufig sind die Verwendeten Substanzen von besonderem Interesse.
'''Beispiel:''' Um nach einem Patienten mit Carboplatin/Etoposid zu suchen, muss folgende Suche in der Erweiterten Suche definiert werden:

[Systemtherapie | Beschreibung | gleich | '''*Carboplatin*'''] UND [Systemtherapie | Beschreibung | gleich | '''*Etoposid*''']

'''Wichtig sind hier wieder die Platzhalter (*), ohne die eine Suche nur zu unvollständigen Ergebnissen führen würde.'''

===Abfrage des Vitalstatus===
Häufig stellt sich die Frage, ob Patienten noch leben oder bereits verstorben sind. Dies kann man über die Erweiterte Suche wie folgt abfragen:

Patient '''lebt noch''': [Patient | Sterbedatum | '''leer''']

Patient '''verstorben''': [Patient | Sterbedatum | '''beliebig'''] oder [Patient | Sterbedatum | '''von-bis''']
[[Datei:Vitalstatussuche.png|left|thumb|without|upright=2.5|Beispiel einer Vitalstatusabfrage]]
[[Category:CentraXX]]

Scientific Board des UCT

2022-08-22T10:13:34Z

Dbrucker: /* Strukturf */

==Beschreibung==
Das '''Scientific Board''' wurde 2014 als wissenschaftliches Gremium innerhalb des Universitären Centrums für Tumorerkrankungen (UCT) gegründet. Es '''prüft alle wissenschaftlichen Projekte''' (mit Biomaterial und Patientendaten, mit Patientendaten ohne Biomaterial) sowie deren Amendments und soll so die '''Qualität eingereichter Projekte verbessern''', eine '''Priorisierung konkurrierender Projekte''' vereinfachen und durch die Einbindung der Pathologien Umsetzung und Kosten für die Projekte frühzeitig abschätzen. Das Scientific Board soll außerdem zur Entlastung der Schwerpunkte und deren Sprechern und zur Beschleunigung der Abläufe beitragen.
==Struktur==
Das Scientific Board wird gebildet durch den Leiter der Biobank (C. Brandts), den Direktor der Biobank (J. Steinbach), dem Geschäftsführer des UCT (C. Brandts), Leiter der neuropathologischen Biobank (K. Weber), Leitung der Studienzentrale (N. Gökbuget), Leitung der Tumordokumentation (G. Husmann), dem Projektmanagement (PM) der Biobank (D. Brucker/K. Götze), sowie einem (gewählten) Vertreter aus jedem tumorspezifischen Schwerpunkt.

==Aufgaben==

*Sichtung, Prüfung und Freigabe von wissenschaftlichen Projekten mit Biomaterial und Patientendaten (und Amendments)
*Sichtung, Prüfung und Freigabe von wissenschaftlichen Projekten mit Patientendaten oder Bildgebung ohne Biomaterial (und Amendments)
*Prüfung von Abschlussberichten und Erteilung der Freigabe für die Ethikkommission.
*Diskussion aktueller Projekte in den Sitzungen
*Die '''Sitzungen finden quartalsweise statt'''

==Begutachtungs- und Bewilligungsprozess von wissenschaftlichen Projekten am UCT==

[[Datei:Scientific_Board.png|upright|thumb|Ablauf von Skizzeneinrichung bis Projektabschluss]]
Das Scientific Board übernimmt die Sichtung, Prüfung und Freigabe von wissenschaftlichen Projekten mit Biomaterial und Patientendaten, sowie von wissenschaftlichen Projekten mit Patientendaten oder Bildgebung ohne Biomaterialbezug sowie deren Amendments für die Ethikkommission.
Die Projekte müssen '''über das Projektmanagemnt-Tool [[ProSkive Projektskizzenverwaltung|APProVe]] oder in schriftlicher Form''' [http://www.uct-frankfurt.de/content/forschung/biobank/biobank_dokumente/e2451/infoboxContent13573/UCT-Projektskizze_ger.doc (UCT-Projektskizzenvorlage)], beim Projektmanagement des UCT (Kristina.Götze@kgu.de) eingereicht werden.
Die eingereichte Projektskizze ist Grundlage für die Bewertung durch das Scientific Board.

In regelmäßigen Sitzungen (einmal pro Quartal) werden aktuelle Projekte bzw. Amendments diskutiert und hinsichtlich folgender Kriterien evaluiert:

*wissenschaftliche Qualität
*Machbarkeit (z.B. hinsichtlich Ausstattung, Methode/Methodenverfügbarkeit, Finanzierung)
*Material (Menge und Verfügbarkeit mit genauer Spezifikation) bzw. Patientenanzahl
*Interdisziplinarität
*Perspektive für externe Förderung
*eigene Vorarbeiten

Im Einzelfall werden die Projektleiter zur Sitzung und Diskussion eingeladen. Die Kommunikation (bzgl. Rückfragen, Freigabe etc.) erfolgt durch das Projektmanagement. In begründeten Fällen kann eine erneute Vorlage in der SB Sitzung verlangt werden. Der einreichende
Schwerpunkt hat bezüglich der Umsetzung von Projekten ein Vetorecht von 14 Tagen.

Nach Bewilligung der Projekte im SB wird über das PM des UCT ein Ethikvotum unterhalb des UCT-Dachvotums bei der Ethikkommission des Fachbereichs Medizin der Goethe-Universität Frankfurt am Main beantragt. Von der Ethik bewilligte Projekte werden für die Durchführung freigegeben und in Kooperation mit der Biobank und/oder Tumordokumentation Materialien und Daten zur Übergabe vorbereitet.

Die Projektleiter berichten dem UCT 1x jährlich (nach Aufforderung) zum Fortgang des Projektes bzw. nach Abschluss der Arbeiten am Projekt (Abschlussbericht). Das PM berichtet an die Ethikkommission.

[[Category:UCT Biobank]]

Scientific Board des UCT

2022-08-22T10:08:16Z

Dbrucker:

==Beschreibung==
Das '''Scientific Board''' wurde 2014 als wissenschaftliches Gremium innerhalb des Universitären Centrums für Tumorerkrankungen (UCT) gegründet. Es '''prüft alle wissenschaftlichen Projekte''' (mit Biomaterial und Patientendaten, mit Patientendaten ohne Biomaterial) sowie deren Amendments und soll so die '''Qualität eingereichter Projekte verbessern''', eine '''Priorisierung konkurrierender Projekte''' vereinfachen und durch die Einbindung der Pathologien Umsetzung und Kosten für die Projekte frühzeitig abschätzen. Das Scientific Board soll außerdem zur Entlastung der Schwerpunkte und deren Sprechern und zur Beschleunigung der Abläufe beitragen.

==Strukturf==
Das Scientific Board wird gebildet durch den Leiter der Biobank (C. Brandts), den Direktor der Biobank (J. Steinbach), dem Geschäftsführer des UCT (C. Brandts), Leiter der neuropathologischen Biobank (M. Mittelbronn), Leitung der Studienzentrale (N. Gökbuget), Leitung der Tumordokumentation (G. Husmann), dem Projektmanagement (PM) der Biobank (D. Brucker/K. Götze), sowie einem (gewählten) Vertreter aus jedem tumorspezifischen Schwerpunkt.

==Aufgaben==

*Sichtung, Prüfung und Freigabe von wissenschaftlichen Projekten mit Biomaterial und Patientendaten (und Amendments)
*Sichtung, Prüfung und Freigabe von wissenschaftlichen Projekten mit Patientendaten oder Bildgebung ohne Biomaterial (und Amendments)
*Prüfung von Abschlussberichten und Erteilung der Freigabe für die Ethikkommission.
*Diskussion aktueller Projekte in den Sitzungen
*Die '''Sitzungen finden quartalsweise statt'''

==Begutachtungs- und Bewilligungsprozess von wissenschaftlichen Projekten am UCT==

[[Datei:Scientific_Board.png|upright|thumb|Ablauf von Skizzeneinrichung bis Projektabschluss]]
Das Scientific Board übernimmt die Sichtung, Prüfung und Freigabe von wissenschaftlichen Projekten mit Biomaterial und Patientendaten, sowie von wissenschaftlichen Projekten mit Patientendaten oder Bildgebung ohne Biomaterialbezug sowie deren Amendments für die Ethikkommission.
Die Projekte müssen '''über das Projektmanagemnt-Tool [[ProSkive Projektskizzenverwaltung|ProSkive]] oder in schriftlicher Form''' [http://www.uct-frankfurt.de/content/forschung/biobank/biobank_dokumente/e2451/infoboxContent13573/UCT-Projektskizze_ger.doc (UCT-Projektskizzenvorlage)], beim Projektmanagement des UCT (Kristina.Götze@kgu.de) eingereicht werden.
Die eingereichte Projektskizze ist Grundlage für die Bewertung durch das Scientific Board.

In regelmäßigen Sitzungen (einmal pro Quartal) werden aktuelle Projekte bzw. Amendments diskutiert und hinsichtlich folgender Kriterien evaluiert:

*wissenschaftliche Qualität
*Machbarkeit (z.B. hinsichtlich Ausstattung, Methode/Methodenverfügbarkeit, Finanzierung)
*Material (Menge und Verfügbarkeit mit genauer Spezifikation) bzw. Patientenanzahl
*Interdisziplinarität
*Perspektive für externe Förderung
*eigene Vorarbeiten

Im Einzelfall werden die Projektleiter zur Sitzung und Diskussion eingeladen. Die Kommunikation (bzgl. Rückfragen, Freigabe etc.) erfolgt durch das Projektmanagement. In begründeten Fällen kann eine erneute Vorlage in der SB Sitzung verlangt werden. Der einreichende
Schwerpunkt hat bezüglich der Umsetzung von Projekten ein Vetorecht von 14 Tagen.

Nach Bewilligung der Projekte im SB wird über das PM des UCT ein Ethikvotum unterhalb des UCT-Dachvotums bei der Ethikkommission des Fachbereichs Medizin der Goethe-Universität Frankfurt am Main beantragt. Von der Ethik bewilligte Projekte werden für die Durchführung freigegeben und in Kooperation mit der Biobank und/oder Tumordokumentation Materialien und Daten zur Übergabe vorbereitet.

Die Projektleiter berichten dem UCT 1x jährlich (nach Aufforderung) zum Fortgang des Projektes bzw. nach Abschluss der Arbeiten am Projekt (Abschlussbericht). Das PM berichtet an die Ethikkommission.

[[Category:UCT Biobank]]

ProSkive Projektskizzenverwaltung

2022-07-06T14:57:38Z

Dbrucker: Dbrucker verschob die Seite ProSkive Projektskizzenverwaltung nach APProVe Projektskizzenverwaltung: Umbenennun APProVe

#WEITERLEITUNG [[APProVe Projektskizzenverwaltung]]

APProVe Projektskizzenverwaltung

2022-07-06T14:57:38Z

Dbrucker: Dbrucker verschob die Seite ProSkive Projektskizzenverwaltung nach APProVe Projektskizzenverwaltung: Umbenennun APProVe

[[Image:ProSkive_Start_User.png|mini|801x801px]]

'''APProVe''' ist eine open source Softwarelösung zur Projektverfolgung bei der Beantragung von Biomaterialien und klinischen Daten an der UCT Biobank.
==Allgemeines==

Am Universitätsklinikum Frankfurt ist die '''UCT Biobank''' die zentrale Einrichtung die Biomaterialien und dazugehörige klinische Daten von Tumorpatienten sammelt, lagert und verwaltet. Wissenschaftler erhalten '''Zugang zu den Biomaterialien und Daten für biomedizinische Forschungszwecke''' nach Einreichung einer '''Projektskizze''', welche durch ein Scientific Board begutachtet und im Anschluss von der lokalen Ethikkommission bewilligt werden muss.

Dieser Prozess wird vom Projektmanagement-Team der UCT Biobank überwacht und begleitet. Bis 2018 wurden die papierbasierten Projektanträge in einer MS-Access Datenbank verwaltet und jede Änderung des Bearbeitungs- und Bewilligungsstatus via Telefon oder Email an die Wissenschaftler weitergeleitet. Dieses Verfahren war zeitaufwendig und für die Wissenschaftler wenig transparent.
[[Image:ProSkive-4.png|thumb|Abbildung 1: Projektskizzenübersicht|links]] Um die Abläufe für alle Beteiligten zu vereinfachen und die Projektverfolgung übersichtlicher zu gestalten, wurde '''APProVe''' entwickelt. Über die ''webbasierte open source Software'' können Wissenschaftler Projektskizzen erstellen und einreichen, den '''Bearbeitungsprozess''' einzelner Projekte verfolgen und erhalten eine übersichtliche '''Zusammenfassung''' über alle eigenen eingereichten Projekte (siehe Abbildung 1).

Auf der anderen Seite, ermöglicht APProVe dem Projektmanagement-Team die Bearbeitung und Verwaltung der Projektanträge, sowie die Kommunikation mit den Wissenschaftlern aus einer zentralen Software heraus, die es zudem ermöglicht Aufgaben und offene Punkte direkt im Projekt mit den Wissenschaftlern zu klären. Im ersten Schritt wurde APProVe als lokale Softwarelösung für die UCT Biobank in Frankfurt entwickelt und wird dort verwendet. Inzwischen wurde mit der Generalisierung der Software-Bausteine begonnen, sodass das Programm an die Begebenheiten in anderen Biobanken angepasst werden kann oder für die Verfolgung anderer Formen des wissenschaftlichen Projekt- oder auch Materialtrackings genutzt werden kann. Zusätzlich wird eine Schnittstelle geschaffen, so dass langfristig auch Kooperationsanfragen von außerhalb entgegengenommen und nach den lokalen Prozessen weiterbearbeitet werden können.

Das UCT-APProVe erreicht man unter https://approve.ibdf-frankfurt.de/

==Neues Projekt einreichen==
[[Image:ProSkive_Allg_Info.png|thumb|Abbildung 2: Startseite|ohne]]

Zur Einreichung eines neuen Projektes müssen allgemeine Informationen, Kooperationen, ein Abstract, Informationen zu gewünschten Daten und Biomaterialen sowie zu ethischen Aspekten finanziellen Förderungen gemacht werden. Nur wenn alle Angaben vollständig hinterlegt sind kann das Projekt eingereicht werden (vollständig grüner Balken links). '''Es findet KEINE Zwischenspeicherung statt!!'''

'''Allgemeine Informationen'''

Zu hinterlegen sind:

*Titel und Laufzeit (in Monaten)
*Projektleitung (Verantwortliche Person für das Projekt)
*Schwerpunkt (Zuordnung zu den Tumorschwerpunkten des UCT)
*Kostenstelle (interne Kostenstelle oder Rechnungsadresse) -> wird für die Abrechnung der Erstellung des Ethikvotums (150€) verwendet
*Antragsart (Neuantrag, Folgeantrag, Verlängerung; weitere Spezifizierungen des Projektantrags möglich )

'''Kooperation'''

Zu hinterlegen sind Angaben zu den Kooperationspartnern sowie die am Projekt beteiligten Personen

'''Abstrakt'''

Zu hinterlegen sind spezifische Angaben zum Projekt:

*Hintergrund
*Zielsetzung
*Eigene Vorarbeiten
*Methoden
*Referenzen (bis zu 5 Angaben möglich)

'''Daten und Biomaterial'''

Hier sind genauere Informationen zu den angeforderten Daten und Biomaterialien zu hinterlegen

*Patientendaten:
**Welche Daten werden benötigt (Datensatz näher beschreiben)?
**Werden Daten aus der Tumordokumentation angefordert?
**Werden eigene Daten verwendet?
*Biomaterialien:
**Gewebeproben (Kryo-, FFPE-, Frischgewebe, Organoide)
**Flüssigproben (Knochenmark, peripheres Blut, Plasma, Serum, Urin, Liquor, Leukapheresat)
**Sonstiges
**Anzahl der Fälle
**Kommentare (möglichst genaue Beschreibung der angeforderten Materialien (Entität, Schnitte, Schnittdicke, Zellzahlen, …)

'''Ethik und Finanzierung'''

Ethische/datenschutzrechtliche Aspekte:

*Welche Patienteninformation und Einverständniserklärung soll verwendet werden (UCT oder eigene)
*Projektfinanzierung
**Ist eine Förderung geplant/vorhanden (Ist schon ein eigenes Ethikvotum vorhanden, so kann die entsprechende Nummer hinterlegt werden.)

'''Angaben zu Personen (Projektleitung oder Projektbeteiligte)'''

[[Image:ProSkive_Suche_Annotated.png|mini|600px| ]]

An Projekten beteiligte Personen können sowohl aus der angeschlossenen Nutzerdatenbank hinzugefügt werden oder händisch eingegeben werden.

'''Zunächst''' mögliche '''Personen IMMER in der Datenbank suchen''' und wenn möglich aus dieser hinzufügen. Erst wenn die Person nicht in der Datenbank gefunden werden könnte, sollte die Person händisch hinzugefügt werden.
[[Kategorie:ProSkive]]
[[Kategorie:UCT Biobank]]

APProVe Projektskizzenverwaltung

2022-07-06T14:56:06Z

Dbrucker:

Hauptseite

2022-07-06T14:54:25Z

Dbrucker:

{{DISPLAYTITLE:WIKI der interdisziplinären Biomaterial- und Datenbank Frankfurt (iBDF)}}
__NOTOC__
__HIDDENCAT__

=WIKI der interdisziplinären Biomaterial- und Datenbank Frankfurt (iBDF)=
==[[über die iBDF]]==
Die '''Interdisziplinäre Biobank und Datenbank Frankfurt (iBDF)''' organisiert die qualitätsgesicherte und datenschutzkonforme Erfassung und Lagerung verschiedener Biomaterialien und verteilt diese an positiv bewertete Forschungsprojekte. Damit stellt das iBDF eine Schlüsselkomponente an der Schnittstelle zwischen Grundlagen-, Translations- und klinischer Forschung dar.



==[[CentraXX]]==
'''Schnellzugriff:'''
[[CentraXX#CentraXX-Oberfl.C3.A4che| Die Oberfläche]] |[[ Suche mit CentraXX ]] |[[ Austausch von Patientenlisten]] |[[CentraXX#Ansprechpartner| Ansprechpartner]] [[Einwilligungsmanagement]] | [[Probenverwaltung]] | [[Lagerverwaltung]]

CentraXX ist aus dem Klinet erreichbar unter: '''https://swamepbbapp1.intra.kgu.de:8443/centraxx/'''



==[[ProSkive Projektskizzenverwaltung|APProVe Projektskizzenverwaltung]]==
'''APProVe''' ist eine open source Softwarelösung zur Projektverfolgung bei der Beantragung von Biomaterialien und klinischen Daten an der UCT Biobank.

APProVe ist aus dem Internet erreichbar unter: '''https://approve.ibdf-frankfurt.de/'''

==[[Scientific Board des UCT]]==
'''Schnellzugriff:'''
[https://www.uct-frankfurt.de/forschung/biobank/uct-biobank.html UCT-Projektskizzeneinreichung]

;'''Nächste Sitzungstermine (Einreichungsfrist):''' https://approve.ibdf-frankfurt.de/

__HIDETITLE__

Hauptseite

2022-07-06T14:53:41Z

Dbrucker:

{{DISPLAYTITLE:WIKI der interdisziplinären Biomaterial- und Datenbank Frankfurt (iBDF)}}
__NOTOC__
__HIDDENCAT__

=WIKI der interdisziplinären Biomaterial- und Datenbank Frankfurt (iBDF)=
==[[über die iBDF]]==
Die '''Interdisziplinäre Biobank und Datenbank Frankfurt (iBDF)''' organisiert die qualitätsgesicherte und datenschutzkonforme Erfassung und Lagerung verschiedener Biomaterialien und verteilt diese an positiv bewertete Forschungsprojekte. Damit stellt das iBDF eine Schlüsselkomponente an der Schnittstelle zwischen Grundlagen-, Translations- und klinischer Forschung dar.



==[[CentraXX]]==
'''Schnellzugriff:'''
[[CentraXX#CentraXX-Oberfl.C3.A4che| Die Oberfläche]] |[[ Suche mit CentraXX ]] |[[ Austausch von Patientenlisten]] |[[CentraXX#Ansprechpartner| Ansprechpartner]] [[Einwilligungsmanagement]] | [[Probenverwaltung]] | [[Lagerverwaltung]]

CentraXX ist aus dem Klinet erreichbar unter: '''https://swamepbbapp1.intra.kgu.de:8443/centraxx/'''



==[[ProSkive Projektskizzenverwaltung|APProVe Projektskizzenverwaltung]]==
'''APProVe''' ist eine open source Softwarelösung zur Projektverfolgung bei der Beantragung von Biomaterialien und klinischen Daten an der UCT Biobank.

APProVe ist aus dem Internet erreichbar unter: '''[https://approve.ibdf-frankfurt.de/ https://approve.ibdf-frankfurt.de/]'''

==[[Scientific Board des UCT]]==
'''Schnellzugriff:'''
[https://www.uct-frankfurt.de/forschung/biobank/uct-biobank.html UCT-Projektskizzeneinreichung]

;'''Nächste Sitzungstermine (Einreichungsfrist):''' https://uct.proskive.de/

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Hauptseite

2022-02-02T14:27:31Z

Dbrucker: Sitzungtermine des SB durch Verlinkung auf uct.proskive.de ersetzt.

{{DISPLAYTITLE:WIKI der interdisziplinären Biomaterial- und Datenbank Frankfurt (iBDF)}}
__NOTOC__
__HIDDENCAT__

=WIKI der interdisziplinären Biomaterial- und Datenbank Frankfurt (iBDF)=
==[[über die iBDF]]==
Die '''Interdisziplinäre Biobank und Datenbank Frankfurt (iBDF)''' organisiert die qualitätsgesicherte und datenschutzkonforme Erfassung und Lagerung verschiedener Biomaterialien und verteilt diese an positiv bewertete Forschungsprojekte. Damit stellt das iBDF eine Schlüsselkomponente an der Schnittstelle zwischen Grundlagen-, Translations- und klinischer Forschung dar.



==[[CentraXX]]==
'''Schnellzugriff:'''
[[CentraXX#CentraXX-Oberfl.C3.A4che| Die Oberfläche]] |[[ Suche mit CentraXX ]] |[[ Austausch von Patientenlisten]] |[[CentraXX#Ansprechpartner| Ansprechpartner]] [[Einwilligungsmanagement]] | [[Probenverwaltung]] | [[Lagerverwaltung]]

CentraXX ist aus dem Klinet erreichbar unter: '''https://swamepbbapp1.intra.kgu.de:8443/centraxx/'''



==[[ProSkive Projektskizzenverwaltung]]==
'''ProSkive''' ist eine open source Softwarelösung zur Projektverfolgung bei der Beantragung von Biomaterialien und klinischen Daten an der UCT Biobank.

ProSkive ist aus dem Internet erreichbar unter: '''https://uct.proskive.de/'''

==[[Scientific Board des UCT]]==
'''Schnellzugriff:'''
[https://www.uct-frankfurt.de/forschung/biobank/uct-biobank.html UCT-Projektskizzeneinreichung]

;'''Nächste Sitzungstermine (Einreichungsfrist):''' https://uct.proskive.de/

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MediaWiki:Group-Tumordokumentation

2020-08-26T10:56:34Z

Dbrucker:

Tumordokumentation

Hauptseite

2020-05-07T12:36:04Z

Dbrucker:

{{DISPLAYTITLE:WIKI der interdisziplinären Biomaterial- und Datenbank Frankfurt (iBDF)}}
__NOTOC__
__HIDDENCAT__

=WIKI der interdisziplinären Biomaterial- und Datenbank Frankfurt (iBDF)=
==[[über die iBDF]]==
Die '''Interdisziplinäre Biobank und Datenbank Frankfurt (iBDF)''' organisiert die qualitätsgesicherte und datenschutzkonforme Erfassung und Lagerung verschiedener Biomaterialien und verteilt diese an positiv bewertete Forschungsprojekte. Damit stellt das iBDF eine Schlüsselkomponente an der Schnittstelle zwischen Grundlagen-, Translations- und klinischer Forschung dar.



==[[CentraXX]]==
'''Schnellzugriff:'''
[[CentraXX#CentraXX-Oberfl.C3.A4che| Die Oberfläche]] |[[ Suche mit CentraXX ]] |[[ Austausch von Patientenlisten]] |[[CentraXX#Ansprechpartner| Ansprechpartner]] [[Einwilligungsmanagement]] | [[Probenverwaltung]] | [[Lagerverwaltung]]

CentraXX ist aus dem Klinet erreichbar unter: '''https://swamepbbapp1.intra.kgu.de:8443/centraxx/'''



==[[ProSkive Projektskizzenverwaltung]]==
'''ProSkive''' ist eine open source Softwarelösung zur Projektverfolgung bei der Beantragung von Biomaterialien und klinischen Daten an der UCT Biobank.

ProSkive ist aus dem Internet erreichbar unter: '''https://uct.proskive.de/'''

==[[Scientific Board des UCT]]==
'''Schnellzugriff:'''
[https://www.uct-frankfurt.de/forschung/biobank/uct-biobank.html UCT-Projektskizzeneinreichung]

;'''Nächste Sitzungstermine (Einreichungsfrist):'''

09.03.2020 (24.02.2020)

08.06.2020 (25.05.2020)

24.08.2020 (10.08.2020)

07.12.2020 (23.11.2020)

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Hauptseite

2020-05-07T12:35:00Z

Dbrucker:

{{DISPLAYTITLE:WIKI der interdisziplinären Biomaterial- und Datenbank Frankfurt (iBDF)}}
__NOTOC__
__HIDDENCAT__

=WIKI der interdisziplinären Biomaterial- und Datenbank Frankfurt (iBDF)=
==[[über die iBDF]]==
Die '''Interdisziplinäre Biobank und Datenbank Frankfurt (iBDF)''' organisiert die qualitätsgesicherte und datenschutzkonforme Erfassung und Lagerung verschiedener Biomaterialien und verteilt diese an positiv bewertete Forschungsprojekte. Damit stellt das iBDF eine Schlüsselkomponente an der Schnittstelle zwischen Grundlagen-, Translations- und klinischer Forschung dar.

;==[[Videokonferenzen über Vidyo]]==
;Aufgrund der vielen Homeoffice-Nutzergibt es einen erhöhten Bedarf an Meeting-Räumen im Internet. Die Uni ;Frankfurt stellt für ihre Mitglieder mit einem HRZ-Account Räume zur Verfügung. Internetportal: ;https://vidyoplatform.mt.uni-frankfurt.de/web/
;
;Portaladresse: vc.uni-frankfurt.de
;
;Login mit den HRZ-Logindaten (wie auch Flughafen, uni-mail und Hessenbox)
;
;Die Applikation hat derzeit Authentifizierungsprobleme. Web funktioniert aber.
==[[CentraXX]]==
'''Schnellzugriff:'''
[[CentraXX#CentraXX-Oberfl.C3.A4che| Die Oberfläche]] |[[ Suche mit CentraXX ]] |[[ Austausch von Patientenlisten]] |[[CentraXX#Ansprechpartner| Ansprechpartner]] [[Einwilligungsmanagement]] | [[Probenverwaltung]] | [[Lagerverwaltung]]

CentraXX ist aus dem Klinet erreichbar unter: '''https://swamepbbapp1.intra.kgu.de:8443/centraxx/'''



==[[ProSkive Projektskizzenverwaltung]]==
'''ProSkive''' ist eine open source Softwarelösung zur Projektverfolgung bei der Beantragung von Biomaterialien und klinischen Daten an der UCT Biobank.

ProSkive ist aus dem Internet erreichbar unter: '''https://uct.proskive.de/'''

==[[Scientific Board des UCT]]==
'''Schnellzugriff:'''
[https://www.uct-frankfurt.de/forschung/biobank/uct-biobank.html UCT-Projektskizzeneinreichung]

;'''Nächste Sitzungstermine (Einreichungsfrist):'''

09.03.2020 (24.02.2020)

08.06.2020 (25.05.2020)

24.08.2020 (10.08.2020)

07.12.2020 (23.11.2020)

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Hauptseite

2020-05-07T12:33:24Z

Dbrucker: /* über die iBDF */

{{DISPLAYTITLE:WIKI der interdisziplinären Biomaterial- und Datenbank Frankfurt (iBDF)}}
__NOTOC__
__HIDDENCAT__

=WIKI der interdisziplinären Biomaterial- und Datenbank Frankfurt (iBDF)=
==[[über die iBDF]]==
Die '''Interdisziplinäre Biobank und Datenbank Frankfurt (iBDF)''' organisiert die qualitätsgesicherte und datenschutzkonforme Erfassung und Lagerung verschiedener Biomaterialien und verteilt diese an positiv bewertete Forschungsprojekte. Damit stellt das iBDF eine Schlüsselkomponente an der Schnittstelle zwischen Grundlagen-, Translations- und klinischer Forschung dar.
==[[Videokonferenzen über Vidyo]]==
Aufgrund der vielen Homeoffice-Nutzergibt es einen erhöhten Bedarf an Meeting-Räumen im Internet. Die Uni Frankfurt stellt für ihre Mitglieder mit einem HRZ-Account Räume zur Verfügung. Internetportal: https://vidyoplatform.mt.uni-frankfurt.de/web/

Portaladresse: vc.uni-frankfurt.de

Login mit den HRZ-Logindaten (wie auch Flughafen, uni-mail und Hessenbox)

Die Applikation hat derzeit Authentifizierungsprobleme. Web funktioniert aber.
==[[CentraXX]]==
'''Schnellzugriff:'''
[[CentraXX#CentraXX-Oberfl.C3.A4che| Die Oberfläche]] |[[ Suche mit CentraXX ]] |[[ Austausch von Patientenlisten]] |[[CentraXX#Ansprechpartner| Ansprechpartner]] [[Einwilligungsmanagement]] | [[Probenverwaltung]] | [[Lagerverwaltung]]

CentraXX ist aus dem Klinet erreichbar unter: '''https://swamepbbapp1.intra.kgu.de:8443/centraxx/'''



==[[ProSkive Projektskizzenverwaltung]]==
'''ProSkive''' ist eine open source Softwarelösung zur Projektverfolgung bei der Beantragung von Biomaterialien und klinischen Daten an der UCT Biobank.

ProSkive ist aus dem Internet erreichbar unter: '''https://uct.proskive.de/'''

==[[Scientific Board des UCT]]==
'''Schnellzugriff:'''
[https://www.uct-frankfurt.de/forschung/biobank/uct-biobank.html UCT-Projektskizzeneinreichung]

;'''Nächste Sitzungstermine (Einreichungsfrist):'''

09.03.2020 (24.02.2020)

08.06.2020 (25.05.2020)

24.08.2020 (10.08.2020)

07.12.2020 (23.11.2020)

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UCT Tumorkonferenzen

2020-03-24T11:58:44Z

Dbrucker: Die Seite wurde neu angelegt: „== Bedienung der Videokonferenzlösung Cisco Webex für die UCT-Tumorkonferenz == Der Zugang zur Tumorkonferenz erfolgt über [https://kgu https://kgu.webex.co…“

== Bedienung der Videokonferenzlösung Cisco Webex für die UCT-Tumorkonferenz ==
Der Zugang zur Tumorkonferenz erfolgt über [https://kgu https://kgu.webex.com/meet/]
[[Datei:TuKo-Web1.png|mini]]

Datei:TuKo-Web1.png

2020-03-24T11:58:32Z

Dbrucker:

Videokonferenzen über Vidyo

2020-03-23T14:05:54Z

Dbrucker:

Aufgrund der vielen Homeoffice-Nutzer gibt es einen erhöhten Bedarf an Meeting-Räumen im Internet. Die Uni Frankfurt stellt für ihre Mitglieder mit einem HRZ-Account Räume zur Verfügung. Internetportal: https://vidyoplatform.mt.uni-frankfurt.de/web/

Portaladresse: vc.uni-frankfurt.de

[[Datei:Vidyo_Portal.png]]

Login mit den HRZ-Logindaten (wie auch Flughafen, uni-mail und Hessenbox)

[[Datei:Vidyo_Login.png]] 

Die Applikation hat derzeit Authentifizierungsprobleme. Web funktioniert aber.

Hier ein Überblick, wie eine Konferenz eingerichtet wird:
[[Datei:Vidyo Startseite.png|links]]
In der Einladungsmail sind Telefonnummern und Links zur Videokonferenz aufgeführt.

'''Eingeladene Personen müssen keine Uni-Angehörige sein. Lediglich der Besprechungsleiter.'''

Wenn der Raum betreten wurde, sieht die Konferenz wie folgt aus:

[[Datei:Videokonferenz.png]]

Weitere Infos finden sich auf den Seiten der Universität:

https://www.rz.uni-frankfurt.de/50324159/Videokonferenzen_mit__Vidyo

Datei:Videokonferenz.png

2020-03-18T12:09:56Z

Dbrucker: Dbrucker lud eine neue Version von Datei:Videokonferenz.png hoch

Datei:Vidyo Startseite.png

2020-03-18T12:08:02Z

Dbrucker: Dbrucker lud eine neue Version von Datei:Vidyo Startseite.png hoch

Videokonferenzen über Vidyo

2020-03-18T12:03:50Z

Dbrucker:

Aufgrund der vielen Homeoffice-Nutzergibt es einen erhöhten Bedarf an Meeting-Räumen im Internet. Die Uni Frankfurt stellt für ihre Mitglieder mit einem HRZ-Account Räume zur Verfügung. Internetportal: https://vidyoplatform.mt.uni-frankfurt.de/web/

Portaladresse: vc.uni-frankfurt.de

[[Datei:Vidyo_Portal.png]]

Login mit den HRZ-Logindaten (wie auch Flughafen, uni-mail und Hessenbox)

[[Datei:Vidyo_Login.png]] 

Die Applikation hat derzeit Authentifizierungsprobleme. Web funktioniert aber.

Hier ein Überblick, wie eine Konferenz eingerichtet wird:
[[Datei:Vidyo Startseite.png|links]]
In der Einladungsmail sind Telefonnummern und Links zur Videokonferenz aufgeführt.

'''Eingeladene Personen müssen keine Uni-Angehörige sein. Lediglich der Besprechungsleiter.'''

Wenn der Raum betreten wurde, sieht die Konferenz wie folgt aus:

[[Datei:Videokonferenz.png]]

Weitere Infos finden sich auf den Seiten der Universität:

https://www.rz.uni-frankfurt.de/50324159/Videokonferenzen_mit__Vidyo

Videokonferenzen über Vidyo

2020-03-17T08:35:17Z

Dbrucker:

Aufgrund der vielen Homeoffice-Nutzergibt es einen erhöhten Bedarf an Meeting-Räumen im Internet. Die Uni Frankfurt stellt für ihre Mitglieder mit einem HRZ-Account Räume zur Verfügung. Internetportal: https://vidyoplatform.mt.uni-frankfurt.de/web/

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Hier ein Überblick, wie eine Konferenz eingerichtet wird:
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In der Einladungsmail sind Telefonnummern und Links zur Videokonferenz aufgeführt.

'''Eingeladene Personen müssen keine Uni-Angehörige sein. Lediglich der Besprechungsleiter.'''

Wenn der Raum betreten wurde, sieht die Konferenz wie folgt aus:

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Videokonferenzen über Vidyo

2020-03-17T08:34:35Z

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2020-03-17T08:29:03Z

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Aufgrund der vielen Homeoffice-Nutzergibt es einen erhöhten Bedarf an Meeting-Räumen im Internet. Die Uni Frankfurt stellt für ihre Mitglieder mit einem HRZ-Account Räume zur Verfügung. Internetportal: https://vidyoplatform.mt.uni-frankfurt.de/web/

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2020-03-17T08:13:27Z

Dbrucker:

{{DISPLAYTITLE:WIKI der interdisziplinären Biomaterial- und Datenbank Frankfurt (iBDF)}}
__NOTOC__
__HIDDENCAT__

=WIKI der interdisziplinären Biomaterial- und Datenbank Frankfurt (iBDF)=
==[https://wiki.proskive.de/w/%C3%9Cber_die_iBDF über die iBDF]==
Die '''Interdisziplinäre Biobank und Datenbank Frankfurt (iBDF)''' organisiert die qualitätsgesicherte und datenschutzkonforme Erfassung und Lagerung verschiedener Biomaterialien und verteilt diese an positiv bewertete Forschungsprojekte. Damit stellt das iBDF eine Schlüsselkomponente an der Schnittstelle zwischen Grundlagen-, Translations- und klinischer Forschung dar.
==[[Videokonferenzen über Vidyo]]==
Aufgrund der vielen Homeoffice-Nutzergibt es einen erhöhten Bedarf an Meeting-Räumen im Internet. Die Uni Frankfurt stellt für ihre Mitglieder mit einem HRZ-Account Räume zur Verfügung. Internetportal: https://vidyoplatform.mt.uni-frankfurt.de/web/

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==[[CentraXX]]==
'''Schnellzugriff:'''
[[CentraXX#CentraXX-Oberfl.C3.A4che| Die Oberfläche]] |[[ Suche mit CentraXX ]] |[[ Austausch von Patientenlisten]] |[[CentraXX#Ansprechpartner| Ansprechpartner]] [[Einwilligungsmanagement]] | [[Probenverwaltung]] | [[Lagerverwaltung]]

CentraXX ist aus dem Klinet erreichbar unter: '''https://swamepbbapp1.intra.kgu.de:8443/centraxx/'''



==[[ProSkive Projektskizzenverwaltung]]==
'''ProSkive''' ist eine open source Softwarelösung zur Projektverfolgung bei der Beantragung von Biomaterialien und klinischen Daten an der UCT Biobank.

ProSkive ist aus dem Internet erreichbar unter: '''https://uct.proskive.de/'''

==[[Scientific Board des UCT]]==
'''Schnellzugriff:'''
[https://www.uct-frankfurt.de/forschung/biobank/uct-biobank.html UCT-Projektskizzeneinreichung]

;'''Nächste Sitzungstermine (Einreichungsfrist):'''

09.03.2020 (24.02.2020)

08.06.2020 (25.05.2020)

24.08.2020 (10.08.2020)

07.12.2020 (23.11.2020)

__HIDETITLE__

Hauptseite

2020-03-17T08:12:27Z

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{{DISPLAYTITLE:WIKI der interdisziplinären Biomaterial- und Datenbank Frankfurt (iBDF)}}
__NOTOC__
__HIDDENCAT__

=WIKI der interdisziplinären Biomaterial- und Datenbank Frankfurt (iBDF)=
==[https://wiki.proskive.de/w/%C3%9Cber_die_iBDF über die iBDF]==
Die '''Interdisziplinäre Biobank und Datenbank Frankfurt (iBDF)''' organisiert die qualitätsgesicherte und datenschutzkonforme Erfassung und Lagerung verschiedener Biomaterialien und verteilt diese an positiv bewertete Forschungsprojekte. Damit stellt das iBDF eine Schlüsselkomponente an der Schnittstelle zwischen Grundlagen-, Translations- und klinischer Forschung dar.
==Videokonferenzen über Vidyo==
Aufgrund der vielen Homeoffice-Nutzergibt es einen erhöhten Bedarf an Meeting-Räumen im Internet. Die Uni Frankfurt stellt für ihre Mitglieder mit einem HRZ-Account Räume zur Verfügung. Internetportal: https://vidyoplatform.mt.uni-frankfurt.de/web/

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Login mit den HRZ-Logindaten (wie auch Flughafen, uni-mail und Hessenbox)

Die Applikation hat derzeit Authentifizierungsprobleme. Web funktioniert aber.
==[[CentraXX]]==
'''Schnellzugriff:'''
[[CentraXX#CentraXX-Oberfl.C3.A4che| Die Oberfläche]] |[[ Suche mit CentraXX ]] |[[ Austausch von Patientenlisten]] |[[CentraXX#Ansprechpartner| Ansprechpartner]] [[Einwilligungsmanagement]] | [[Probenverwaltung]] | [[Lagerverwaltung]]

CentraXX ist aus dem Klinet erreichbar unter: '''https://swamepbbapp1.intra.kgu.de:8443/centraxx/'''



==[[ProSkive Projektskizzenverwaltung]]==
'''ProSkive''' ist eine open source Softwarelösung zur Projektverfolgung bei der Beantragung von Biomaterialien und klinischen Daten an der UCT Biobank.

ProSkive ist aus dem Internet erreichbar unter: '''https://uct.proskive.de/'''

==[[Scientific Board des UCT]]==
'''Schnellzugriff:'''
[https://www.uct-frankfurt.de/forschung/biobank/uct-biobank.html UCT-Projektskizzeneinreichung]

;'''Nächste Sitzungstermine (Einreichungsfrist):'''

09.03.2020 (24.02.2020)

08.06.2020 (25.05.2020)

24.08.2020 (10.08.2020)

07.12.2020 (23.11.2020)

__HIDETITLE__

Scientific Board des UCT

2020-02-05T13:33:39Z

Dbrucker: Die Kategorien wurden geändert.

==Beschreibung==
Das '''Scientific Board''' wurde 2014 als wissenschaftliches Gremium innerhalb des Universitären Centrums für Tumorerkrankungen (UCT) gegründet. Es '''prüft alle wissenschaftlichen Projekte''' (mit Biomaterial und Patientendaten, mit Patientendaten ohne Biomaterial) sowie deren Amendments und soll so die '''Qualität eingereichter Projekte verbessern''', eine '''Priorisierung konkurrierender Projekte''' vereinfachen und durch die Einbindung der Pathologien Umsetzung und Kosten für die Projekte frühzeitig abschätzen. Das Scientific Board soll außerdem zur Entlastung der Schwerpunkte und deren Sprechern und zur Beschleunigung der Abläufe beitragen.

==Struktur==
Das Scientific Board wird gebildet durch den Leiter der Biobank (C. Brandts), den Direktor der Biobank (J. Steinbach), dem Geschäftsführer des UCT (C. Brandts), Leiter der neuropathologischen Biobank (M. Mittelbronn), Leitung der Studienzentrale (N. Gökbuget), Leitung der Tumordokumentation (G. Husmann), dem Projektmanagement (PM) der Biobank (D. Brucker/K. Götze), sowie einem (gewählten) Vertreter aus jedem tumorspezifischen Schwerpunkt.

==Aufgaben==

*Sichtung, Prüfung und Freigabe von wissenschaftlichen Projekten mit Biomaterial und Patientendaten (und Amendments)
*Sichtung, Prüfung und Freigabe von wissenschaftlichen Projekten mit Patientendaten oder Bildgebung ohne Biomaterial (und Amendments)
*Prüfung von Abschlussberichten und Erteilung der Freigabe für die Ethikkommission.
*Diskussion aktueller Projekte in den Sitzungen
*Die '''Sitzungen finden quartalsweise statt'''

==Begutachtungs- und Bewilligungsprozess von wissenschaftlichen Projekten am UCT==

[[Datei:Scientific_Board.png|upright|thumb|Ablauf von Skizzeneinrichung bis Projektabschluss]]
Das Scientific Board übernimmt die Sichtung, Prüfung und Freigabe von wissenschaftlichen Projekten mit Biomaterial und Patientendaten, sowie von wissenschaftlichen Projekten mit Patientendaten oder Bildgebung ohne Biomaterialbezug sowie deren Amendments für die Ethikkommission.
Die Projekte müssen '''über das Projektmanagemnt-Tool [[ProSkive Projektskizzenverwaltung|ProSkive]] oder in schriftlicher Form''' [http://www.uct-frankfurt.de/content/forschung/biobank/biobank_dokumente/e2451/infoboxContent13573/UCT-Projektskizze_ger.doc (UCT-Projektskizzenvorlage)], beim Projektmanagement des UCT (Kristina.Götze@kgu.de) eingereicht werden.
Die eingereichte Projektskizze ist Grundlage für die Bewertung durch das Scientific Board.

In regelmäßigen Sitzungen (einmal pro Quartal) werden aktuelle Projekte bzw. Amendments diskutiert und hinsichtlich folgender Kriterien evaluiert:

*wissenschaftliche Qualität
*Machbarkeit (z.B. hinsichtlich Ausstattung, Methode/Methodenverfügbarkeit, Finanzierung)
*Material (Menge und Verfügbarkeit mit genauer Spezifikation) bzw. Patientenanzahl
*Interdisziplinarität
*Perspektive für externe Förderung
*eigene Vorarbeiten

Im Einzelfall werden die Projektleiter zur Sitzung und Diskussion eingeladen. Die Kommunikation (bzgl. Rückfragen, Freigabe etc.) erfolgt durch das Projektmanagement. In begründeten Fällen kann eine erneute Vorlage in der SB Sitzung verlangt werden. Der einreichende
Schwerpunkt hat bezüglich der Umsetzung von Projekten ein Vetorecht von 14 Tagen.

Nach Bewilligung der Projekte im SB wird über das PM des UCT ein Ethikvotum unterhalb des UCT-Dachvotums bei der Ethikkommission des Fachbereichs Medizin der Goethe-Universität Frankfurt am Main beantragt. Von der Ethik bewilligte Projekte werden für die Durchführung freigegeben und in Kooperation mit der Biobank und/oder Tumordokumentation Materialien und Daten zur Übergabe vorbereitet.

Die Projektleiter berichten dem UCT 1x jährlich (nach Aufforderung) zum Fortgang des Projektes bzw. nach Abschluss der Arbeiten am Projekt (Abschlussbericht). Das PM berichtet an die Ethikkommission.

[[Category:UCT Biobank]]

APProVe Projektskizzenverwaltung

2020-02-05T13:33:12Z

Dbrucker:

[[Image:ProSkive_Start_User.png|mini|801x801px]]

'''ProSkive''' ist eine open source Softwarelösung zur Projektverfolgung bei der Beantragung von Biomaterialien und klinischen Daten an der UCT Biobank.
==Allgemeines==

Am Universitätsklinikum Frankfurt ist die '''UCT Biobank''' die zentrale Einrichtung die Biomaterialien und dazugehörige klinische Daten von Tumorpatienten sammelt, lagert und verwaltet. Wissenschaftler erhalten '''Zugang zu den Biomaterialien und Daten für biomedizinische Forschungszwecke''' nach Einreichung einer '''Projektskizze''', welche durch ein Scientific Board begutachtet und im Anschluss von der lokalen Ethikkommission bewilligt werden muss.

Dieser Prozess wird vom Projektmanagement-Team der UCT Biobank überwacht und begleitet. Bis 2018 wurden die papierbasierten Projektanträge in einer MS-Access Datenbank verwaltet und jede Änderung des Bearbeitungs- und Bewilligungsstatus via Telefon oder Email an die Wissenschaftler weitergeleitet. Dieses Verfahren war zeitaufwendig und für die Wissenschaftler wenig transparent.
[[Image:ProSkive-4.png|thumb|Abbildung 1: Projektskizzenübersicht|links]] Um die Abläufe für alle Beteiligten zu vereinfachen und die Projektverfolgung übersichtlicher zu gestalten, wurde '''ProSkive''' entwickelt. Über die ''webbasierte open source Software'' können Wissenschaftler Projektskizzen erstellen und einreichen, den '''Bearbeitungsprozess''' einzelner Projekte verfolgen und erhalten eine übersichtliche '''Zusammenfassung''' über alle eigenen eingereichten Projekte (siehe Abbildung 1).

Auf der anderen Seite, ermöglicht ProSkive dem Projektmanagement-Team die Bearbeitung und Verwaltung der Projektanträge, sowie die Kommunikation mit den Wissenschaftlern aus einer zentralen Software heraus, die es zudem ermöglicht Aufgaben und offene Punkte direkt im Projekt mit den Wissenschaftlern zu klären. Im ersten Schritt wurde ProSkive als lokale Softwarelösung für die UCT Biobank in Frankfurt entwickelt und wird dort verwendet. Inzwischen wurde mit der Generalisierung der Software-Bausteine begonnen, sodass das Programm an die Begebenheiten in anderen Biobanken angepasst werden kann oder für die Verfolgung anderer Formen des wissenschaftlichen Projekt- oder auch Materialtrackings genutzt werden kann. Zusätzlich wird eine Schnittstelle geschaffen, so dass langfristig auch Kooperationsanfragen von außerhalb entgegengenommen und nach den lokalen Prozessen weiterbearbeitet werden können.

Das UCT-ProSkive erreicht man unter https://uct.proskive.de/

==Neues Projekt einreichen==
[[Image:ProSkive_Allg_Info.png|thumb|Abbildung 2: Startseite|ohne]]

Zur Einreichung eines neuen Projektes müssen allgemeine Informationen, Kooperationen, ein Abstract, Informationen zu gewünschten Daten und Biomaterialen sowie zu ethischen Aspekten finanziellen Förderungen gemacht werden. Nur wenn alle Angaben vollständig hinterlegt sind kann das Projekt eingereicht werden (vollständig grüner Balken links). '''Es findet KEINE Zwischenspeicherung statt!!'''

'''Allgemeine Informationen'''

Zu hinterlegen sind:

*Titel und Laufzeit (in Monaten)
*Projektleitung (Verantwortliche Person für das Projekt)
*Schwerpunkt (Zuordnung zu den Tumorschwerpunkten des UCT)
*Kostenstelle (interne Kostenstelle oder Rechnungsadresse) -> wird für die Abrechnung der Erstellung des Ethikvotums (150€) verwendet
*Antragsart (Neuantrag, Folgeantrag, Verlängerung; weitere Spezifizierungen des Projektantrags möglich )

'''Kooperation'''

Zu hinterlegen sind Angaben zu den Kooperationspartnern sowie die am Projekt beteiligten Personen

'''Abstrakt'''

Zu hinterlegen sind spezifische Angaben zum Projekt:

*Hintergrund
*Zielsetzung
*Eigene Vorarbeiten
*Methoden
*Referenzen (bis zu 5 Angaben möglich)

'''Daten und Biomaterial'''

Hier sind genauere Informationen zu den angeforderten Daten und Biomaterialien zu hinterlegen

*Patientendaten:
**Welche Daten werden benötigt (Datensatz näher beschreiben)?
**Werden Daten aus der Tumordokumentation angefordert?
**Werden eigene Daten verwendet?
*Biomaterialien:
**Gewebeproben (Kryo-, FFPE-, Frischgewebe, Organoide)
**Flüssigproben (Knochenmark, peripheres Blut, Plasma, Serum, Urin, Liquor, Leukapheresat)
**Sonstiges
**Anzahl der Fälle
**Kommentare (möglichst genaue Beschreibung der angeforderten Materialien (Entität, Schnitte, Schnittdicke, Zellzahlen, …)

'''Ethik und Finanzierung'''

Ethische/datenschutzrechtliche Aspekte:

*Welche Patienteninformation und Einverständniserklärung soll verwendet werden (UCT oder eigene)
*Projektfinanzierung
**Ist eine Förderung geplant/vorhanden (Ist schon ein eigenes Ethikvotum vorhanden, so kann die entsprechende Nummer hinterlegt werden.)

'''Angaben zu Personen (Projektleitung oder Projektbeteiligte)'''

[[Image:ProSkive_Suche_Annotated.png|mini|600px| ]]

An Projekten beteiligte Personen können sowohl aus der angeschlossenen Nutzerdatenbank hinzugefügt werden oder händisch eingegeben werden.

'''Zunächst''' mögliche '''Personen IMMER in der Datenbank suchen''' und wenn möglich aus dieser hinzufügen. Erst wenn die Person nicht in der Datenbank gefunden werden könnte, sollte die Person händisch hinzugefügt werden.
[[Kategorie:ProSkive]]
[[Kategorie:UCT Biobank]]

Über die iBDF

2020-02-05T13:31:27Z

Dbrucker: Die Kategorien wurden geändert.

==Die iBDF==
Um den medizinischen Fortschritt voranzutreiben und insbesondere die Entwicklung und Verbesserung von Diagnosemethoden und Therapien zu beschleunigen, ist eine umfassende medizinische Forschung erforderlich. Die Interdisziplinäre Biobank und Datenbank Frankfurt (iBDF) organisiert die qualitätsgesicherte und datenschutzkonforme Erfassung und Lagerung verschiedener Biomaterialien und verteilt diese an positiv bewertete Forschungsprojekte. Damit stellt das iBDF eine Schlüsselkomponente an der Schnittstelle zwischen Grundlagen-, Translations- und klinischer Forschung dar. Die Biobank konzentrierte sich ursprünglich ausschließlich auf Tumorgewebe, hat sich aber zu einer campusweiten Biomaterialsammlung entwickelt, die Proben aus allen Bereichen umfasst, darunter kardiovaskuläre, neurologische, psychiatrische sowie Traumapatienten und Patienten mit Infektionskrankheiten.

Bei den entnommenen Proben handelt es sich um übriggebliebenes Material aus Gewebe, Blut, Knochenmark oder anderen Körperflüssigkeiten, die während der Behandlung/Operation aus diagnostischen oder therapeutischen Gründen entnommen werden. Diese Materialien werden in den pathologischen Instituten und Labors des Universitätsklinikums Frankfurt im Rahmen der Diagnostik analysiert. Mit Zustimmung des Patienten werden die Biomaterialien eingefroren oder chemisch fixiert in der Biobank gelagert. Nach der Genehmigung durch den wissenschaftlichen Beirat und das lokale Ethikkomitee werden die Biomaterialien für wissenschaftliche Projekte verwendet.

Die Sammlung und Lagerung von Biomaterialien innerhalb des iBDF wird an verschiedenen Orten am Universitätsklinikum durchgeführt, z.B. in der Pathologie, Neuropathologie, Hämatologie, Virologie, Mikrobiologie, Psychiatrie, Kinder- und Jugendpsychiatrie, Kardiologie und Traumatologie.

Das Management und die klinische Annotation von Biomaterialien wird zentral vom UCT-Projektmanagement-Team mit einer leistungsfähigen IT-Lösung (CentraXX) organisiert. Mit dieser Software wird Biomaterial mit klinischen Daten versehen und stellt eine wertvolle Ressource für Kliniker und laborgestützte Wissenschaftler für die Entwicklung neuer diagnostischer und therapeutischer Ansätze dar.

Seit 2016 ist der iBDF aktives Mitglied der Deutschen Biobank-Allianz (GBA). Ziel dieses vom BMBF/DLR geförderten Netzwerks ist die Harmonisierung von Biobanking-Prozessen und -Infrastruktur in Deutschland.

==Sammlungen in der iBDF==

===Die UCT Biobank===
Die UCT Biobank wurde 2009 gegründet, um die bisher unabhängig organisierten Biobanken aus jeder tumorspezifischen Klinik zusammenzuführen. Ziel war es, die Sammlung, Speicherung und Bereitstellung von onkologiebezogenem Biomaterial zu zentralisieren und zu harmonisieren. Die UCT-Biobank wurde von der lokalen Ethikkommission positiv bewertet (Referenz 4/09; erweiterte Abstimmung 2015) und ist seit 2011 Teil der iBDF.

Seit 2013 werden alle entnommenen Proben mit einem zentralen Softwaretool (CentraXX) verwaltet, bei dem pseudonymisiertes Biomaterial direkt mit klinischen Daten der Patienten verknüpft ist. Biomaterial- und klinische Daten werden nur für wissenschaftliche Projekte vergeben, wenn ein Projektantrag vom wissenschaftlichen Beirat und der Ethikkommission genehmigt wird.

Aus logistischen Gründen Sammelt die UCT Biobank an vier verschiedenen Standorten Proben:

Institut für Pathologie (Sammlung solider Tumorproben)

Institut für Neuropathologie (Sammlung von Tumoren des zentralen Nervensystems)

Medizinische Klinik II, Abteilung für Hämatologie (Aufbereitung von Immunzellen aus Blut- und Knochenmarkproben)

Onkologische Abteilung des Krankenhauses Nordwest (Sammlung aller onkologischen Proben am KHNW)

Alle beteiligten Partner sind nach DIN ISO 9001:2008 zertifiziert und arbeiten mit harmonisierten und zentral verwalteten SOPs. Die UCT und damit die UCT Biobank ist Mitglied im Konsortium für translationale Krebsforschung (DKTK), in dem die deutschlandweite Zusammenarbeit von Biobanken mit onkologischem Schwerpunkt vorangetrieben wird. 

==Die German Biobank Alliance==
[[Datei:csm_GBN_CMYK_schwarz_b55955cd30.png|links|rahmenlos|300x300px]]
Der German Biobank Node (GBN) ist ein deutsches Biobank-Netzwerk, das aus elf großen universitären Biobankstandorten besteht. Unter dem Dach von GBN arbeiten alle Biobank-Partner in der Deutschen Biobank-Allianz (GBA) zusammen, um die biomedizinische Forschung mit hochwertigen Biomaterialproben und -daten zu unterstützen. Die Interdisziplinäre Biobank und Datenbank Frankfurt (iBDF) ist Partner in dieser Allianz. Gemeinsam entwickeln sie einheitliche Qualitätsstandards, etablieren eine vernetzte IT-Struktur und erstellen rechtliche und ethische Richtlinien für das Biobanking. Damit legen sie den Grundstein für die Weiterentwicklung und Qualitätssicherung des Biobankings in Deutschland und Europa. Das Netzwerk wird vom Bundesministerium für Bildung und Forschung (BMBF) gefördert.

GBN ist auch weiterhin Partner im europäischen Biobank-Netzwerk BBMRI-ERIC, das sich auf die Vernetzung und den Erfahrungsaustausch von Biobanken in Europa konzentriert.
[[Category:Biobank]]

Scientific Board des UCT

2020-02-05T13:31:09Z

Dbrucker:

==Beschreibung==
Das '''Scientific Board''' wurde 2014 als wissenschaftliches Gremium innerhalb des Universitären Centrums für Tumorerkrankungen (UCT) gegründet. Es '''prüft alle wissenschaftlichen Projekte''' (mit Biomaterial und Patientendaten, mit Patientendaten ohne Biomaterial) sowie deren Amendments und soll so die '''Qualität eingereichter Projekte verbessern''', eine '''Priorisierung konkurrierender Projekte''' vereinfachen und durch die Einbindung der Pathologien Umsetzung und Kosten für die Projekte frühzeitig abschätzen. Das Scientific Board soll außerdem zur Entlastung der Schwerpunkte und deren Sprechern und zur Beschleunigung der Abläufe beitragen.

==Struktur==
Das Scientific Board wird gebildet durch den Leiter der Biobank (C. Brandts), den Direktor der Biobank (J. Steinbach), dem Geschäftsführer des UCT (C. Brandts), Leiter der neuropathologischen Biobank (M. Mittelbronn), Leitung der Studienzentrale (N. Gökbuget), Leitung der Tumordokumentation (G. Husmann), dem Projektmanagement (PM) der Biobank (D. Brucker/K. Götze), sowie einem (gewählten) Vertreter aus jedem tumorspezifischen Schwerpunkt.

==Aufgaben==

*Sichtung, Prüfung und Freigabe von wissenschaftlichen Projekten mit Biomaterial und Patientendaten (und Amendments)
*Sichtung, Prüfung und Freigabe von wissenschaftlichen Projekten mit Patientendaten oder Bildgebung ohne Biomaterial (und Amendments)
*Prüfung von Abschlussberichten und Erteilung der Freigabe für die Ethikkommission.
*Diskussion aktueller Projekte in den Sitzungen
*Die '''Sitzungen finden quartalsweise statt'''

==Begutachtungs- und Bewilligungsprozess von wissenschaftlichen Projekten am UCT==

[[Datei:Scientific_Board.png|upright|thumb|Ablauf von Skizzeneinrichung bis Projektabschluss]]
Das Scientific Board übernimmt die Sichtung, Prüfung und Freigabe von wissenschaftlichen Projekten mit Biomaterial und Patientendaten, sowie von wissenschaftlichen Projekten mit Patientendaten oder Bildgebung ohne Biomaterialbezug sowie deren Amendments für die Ethikkommission.
Die Projekte müssen '''über das Projektmanagemnt-Tool [[ProSkive Projektskizzenverwaltung|ProSkive]] oder in schriftlicher Form''' [http://www.uct-frankfurt.de/content/forschung/biobank/biobank_dokumente/e2451/infoboxContent13573/UCT-Projektskizze_ger.doc (UCT-Projektskizzenvorlage)], beim Projektmanagement des UCT (Kristina.Götze@kgu.de) eingereicht werden.
Die eingereichte Projektskizze ist Grundlage für die Bewertung durch das Scientific Board.

In regelmäßigen Sitzungen (einmal pro Quartal) werden aktuelle Projekte bzw. Amendments diskutiert und hinsichtlich folgender Kriterien evaluiert:

*wissenschaftliche Qualität
*Machbarkeit (z.B. hinsichtlich Ausstattung, Methode/Methodenverfügbarkeit, Finanzierung)
*Material (Menge und Verfügbarkeit mit genauer Spezifikation) bzw. Patientenanzahl
*Interdisziplinarität
*Perspektive für externe Förderung
*eigene Vorarbeiten

Im Einzelfall werden die Projektleiter zur Sitzung und Diskussion eingeladen. Die Kommunikation (bzgl. Rückfragen, Freigabe etc.) erfolgt durch das Projektmanagement. In begründeten Fällen kann eine erneute Vorlage in der SB Sitzung verlangt werden. Der einreichende
Schwerpunkt hat bezüglich der Umsetzung von Projekten ein Vetorecht von 14 Tagen.

Nach Bewilligung der Projekte im SB wird über das PM des UCT ein Ethikvotum unterhalb des UCT-Dachvotums bei der Ethikkommission des Fachbereichs Medizin der Goethe-Universität Frankfurt am Main beantragt. Von der Ethik bewilligte Projekte werden für die Durchführung freigegeben und in Kooperation mit der Biobank und/oder Tumordokumentation Materialien und Daten zur Übergabe vorbereitet.

Die Projektleiter berichten dem UCT 1x jährlich (nach Aufforderung) zum Fortgang des Projektes bzw. nach Abschluss der Arbeiten am Projekt (Abschlussbericht). Das PM berichtet an die Ethikkommission.
[[Kategorie:Biobank]]

APProVe Projektskizzenverwaltung

2020-02-05T13:30:27Z

Dbrucker:

Probenverwaltung

2020-02-05T13:28:59Z

Dbrucker: Die Kategorien wurden geändert.

zurück zum Hauptartikel [[CentraXX]]

Es gibt verschiedene Möglichkeiten, um zur Probenverwaltung zu gelangen

•Über die '''Probensuche''' (ggf. auch lokale Suche benutzen, wenn Patient / Probe nicht gefunden wird)

•Über die '''Patientensuche'''

•Über den '''Reiter „Probenverwaltung“''' " Dadurch gelangt man entweder zum Patienten oder direkt zu den Proben

Im Reiter „Proben“ befinden sich folgende Schaltflächen
[[Datei:SYM Anlage.png|links|rahmenlos|44x44px|[[Probenverwaltung/Probe manuell anlegen]]]]
•Probe (manuell) anlegen

•Bearbeitung (Stammprobe oder Derivate)

•Löschen

•Merkliste (Mehrfachbearbeitung)

•Prozessieren / Aliquotieren

•Einlagern / Umlagern

•Abgabe

•Rücklauf

•PDF erstellen

•Änderungsverlauf (nur für zugelassene User sichtbar)
 
[[Category:CentraXX]]
[[Category:In Bearbeitung]]

Lagerverwaltung

2020-02-05T13:28:43Z

Dbrucker:

zurück zum Hauptartikel [[CentraXX]]
[[Category:CentraXX]]
[[Kategorie:In Bearbeitung]]

Lagerverwaltung

2020-02-05T13:28:20Z

Dbrucker: Die Kategorien wurden geändert.

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[[Category:CentraXX]]

Einwilligungsmanagement

2020-02-05T13:28:07Z

Dbrucker: Die Kategorien wurden geändert.

zurück zum Hauptartikel [[CentraXX]]

Der Status der Einwilligung des Broad Consent zur Material- und Datenverwaltung und zur Studienteilnahme des Patienten kann im Stammdatenblatt des Patienten hinterlegt werden.

[[Datei:Patientenstammblatt_CentraXX.png|600x600px]]

Hierzu kann in der rechten Hälfte des Stammblatts eine Einwilligung hinzugefügt und auch ein entsprechender Widerruf hinterlegt werden.

Das Subformular sieht wie folgt aus:

[[Datei:Formular_iBDF_Broad_Consent_CXX.png|rahmenlos]]

Hier kann sowohl die komplette Einwilligung als auch alle Teilaspekte der Einwilligung hinterlegt und widerrufe verwaltet werden. Ebenso können die relevanten Daten (Erteilung, Gültigkeit) eingetragen werden.

Bei der Anlage einer Einwilligung sollte darauf geachtet werden, dass sie sich im Normalfall auf den Patienten und nicht auf die Probe bezieht.

Im Normalfall wird die '''Einwilligung zum Broad Consent automatisch aus Orbis nach CentraXX übertragen''' und dort abgebildet.

Es ist jedoch möglich, dass beliebige Einwilligungen (z.B. studienspezifische Einwilligungen) hinterlegt und somit zukünftig in CentraXX vom Anwender angelegt werden können. Hierzu wenden Sie sich bitte an UCT-IBDF@kgu.de.

 
[[Category:CentraXX]]

Austausch von Patientenlisten

2020-02-05T13:27:58Z

Dbrucker: Die Kategorien wurden geändert.

zurück zum Hauptartikel [[CentraXX]]
__NOTOC__

Die in CentraXX gewonnenen '''Suchergebnisse''' lassen sich unter Einhaltung aller datenschutzrechtlichen Regeln zwischen Benutzern und vor allem zwischen Nutzern und dem BioBank-Projektmanagement '''austauschen'''. Dies ist zum Beispiel notwendig, um '''Biomaterial''' von Patienten '''anzufordern'''.
;Der Ablauf stellt sich wie folgt dar:
:# Zusammenstellen einer '''Merkliste'''
:# Hinzufügen der Merkliste zu einer '''Aufgabe'''
:# '''Übergabe''' der Aufgabe an sich selbst (zum Speichern der Merkliste) oder an einen anderen Benutzer

==Erstellung einer Merkliste==
[[Image:Patienten_auf_Merkliste.jpg|thumb|Sammeln von Patienten auf der Merkliste]]
Um eine '''Merkliste''' in CentraXX zu '''erstellen''' geht man wie folgt vor:
# Suche mit den gewünschten Merkmalen durchführen
# Gewünschte Patienten in den Suchlisten markieren (Mehrfachauswahl über Strg+Klick)
# Übernahme der markierten Patienten in die Merkliste mit dem Button mit dem gelben Notizblock [[Datei:SYM Merkliste.png]]rechts neben der Liste

Die Patienten werden dann in die Merkliste gelegt. Diese funktioniert wie der "Einkaufswagen" in Onlineshops. Die Merkliste kann auch Zug um Zug mit Patienten befüllt werden.

'''Achtung:''' Sobald die '''Sitzung geschlossen''' wurde, ist die Merkliste wieder '''leer'''! Daher darf bei der schrittweisen Befüllung einer Merkliste zwischendurch der Browser nicht geschlossen werden. 

==Speichern von Merklisten==

[[Image:Merkliste Patienten.jpg|thumb|Merkliste mit Patienten]]
Um Merklisten für die weitere Verwendung ablegen zu können, gibt es die Möglichkeit, diese in Form von '''Aufgabenlisten''' zu speichern. Diese Listen werden standardmäßig dem eigenen Benutzer zugewiesen. Sie können von anderen Anwendern nicht eingesehen werden. Nach dem erneuten Einloggen in CentraXX können die Merklisten dann aus den abgespeicherten Aufgaben wieder befüllt werden. Dazu muss man wie folgt vorgehen:
# Falls eine Merkliste vorhanden ist, wird dies durch den kleinen Notizblock [[Datei:SYM Merkliste.png]]unten links angezeigt
# Ein Klick auf den Notizblock [[Datei:SYM Merkliste.png]]zeigt rechts oben die Anzahl der Patienten auf der Merkliste an. Man kann mit den vorhandenen Auswahlmöglichkeiten die Merkliste anzeigen, minimieren, leeren oder aber die Merkliste an einen Workflow-Prozess übergeben. Workflows werden nur in den Pathologien eingesetzt und sind daher für Anwender bisher nicht verfügbar.
# Die Auswahl von "Anzeigen" öffnet die Merkliste und zeigt die darauf vorhandenen Patienten an
# Um alle Patienten der Liste zu speichern, muss zuerst der erste Patient, und dann bei gedrückter Shift-Taste der letzte Patient angeklickt werden. Nun können über das "Klemmbrett-Symbol" rechts [[Image:SYM_Aufgabe.png]] die angewählten Patienten als Anlage zu einer Aufgabe übertragen werden.[[Image:Aufgabe_Erstellen.jpg|thumb|Erstellen einer Aufgabe]]
# Das nun geöffnete Aufgabenfenster muss im Feld "Kurzbeschreibung" mit einem Bezeichner versehen werden.
# Falls die für spätere Zwecke abgelegt werden soll, muss keine Änderung bei "Bearbeiter" durchgeführt werden. Per Standard ist hier immer der Nutzer ausgewählt. Um eine Liste an einen anderen Nutzer (z.B. die BioBank) weitergeben zu können, muss hier ein anderer Empfänger ausgewählt werden.
# Im unteren Bereich des Fensters lässt sich eine ausführliche Beschreibung erfassen. Unter dem Reiter '''Anhänge''' befinden sich die aus der Merkliste '''übernommenen Patienten'''.
# Durch Drücken der Schaltfläche "Speichern" wird die Aufgabe abgespeichert und kann unter dem Menüpunkt '''[CentraXX | Aufgaben]''' wieder aufgerufen werden [[Austausch_von_Patientenlisten#Aufgaben_verwalten|(siehe unten)]].

==Übergabe von Listen an die BIOBANK==

Wie bereits oben erwähnt, kann über die '''Auswahl eines anderen Benutzers''' eine Patientenliste innerhalb der Datenbank übergeben werden.

'''Um Patienten an das BioBank-Projektmanagement zu übergeben, müssen diese in Form einer Aufgabe nach vorheriger Rücksprache an den Benutzer "BIOBANK" weitergereicht werden'''. Dafür wird bei Erstellung der Aufgabe der Benutzer '''BIOBANK als Bearbeiter''' ausgewählt. In diesem Fall sollte der Aufgabenbetreff und die Beschreibung ausführlich genug verfasst werden, damit die BioBank den Auftrag bearbeiten kann.

:Folgende Informationen sollten Teil der Aufgabenbeschreibung sein:
;Projektname
;Projektnummer, die vom PM nach Antragsbewilligung vergeben wurde
;Gewünschtes Material (siehe Materialspezifikationsbogen der Projektskizze)
:* Beschreibung der gewünschten Entität (ICD-Code)
:* Materialtyp (Kryo/FFPE-Gewebe, Knochenmark, etc.)
:* Probenart (Schnitt bzw. Block; EDTA/Heparin)
;Anzahl
:* Anzahl der Fälle
:* Schnitte pro Fall bzw. Menge (Zellzahl)
;Telefonnummer und Email für Rückfragen

==Aufgaben verwalten==
Die Aufgabenverwaltung befindet sich unter dem Menü [CentraXX | Aufgaben]. Hier werden alle Aufgaben verwaltet, die vom Benutzer erstellt wurden oder an den Benutzer übergeben wurden sind. Grundsätzlich können hier Aufgaben angelegt, bearbeitet und gelöscht werden. Das Löschen von Aufgaben kann nur vom Aufgabenersteller durchgeführt werden.



==Patienten aus Aufgaben auf die Merkliste setzen==

[[Image:Patient_aus_Aufgabe_auf_Merkliste.jpg|thumb|Patienten aus Aufgaben auf die Merkliste importieren]]Um Patienten auf die Merkliste zu setzen, welche in früheren Sessions in Form von Aufgabenlisten gespeichert wurden müssen folgende Schritte durchgeführt werden:
# Öffnen des Aufgabenbereichs über das Menü {CentraXX | Aufgaben]
# Es werden alle Aufgaben angezeigt, die dem User zugeordnet wurden, also auch die Aufgaben, die man sich selbst hinterlegt hat
# Öffnen der hinterlegten Aufgabe per Doppelklick oder Klick auf den Bleistift rechts neben der Aufgabenliste
# Unter dem Reiter "Anhänge" finden sich die hinterlegten Patienten. Patienten, welche auf die Merkliste gesetzt werden sollen, müssen zuerst markiert werden und werden durch einen Klick auf den gelben Notizzettel auf die Merklsite geschoben. Eventuell bereits vorhandene Patienten verbleiben auf der Merkliste. Es können auf diese Weise also auch neue Listen aus mehereren Aufgaben zusammengestellt werden.

Über den Button mit dem Plus-Zeichen können außerdem direkt Patienten zu einer Aufgabe hinzugefügt werden, ohne den Umweg über die Suche gehen zu müssen.
[[Category:CentraXX]]

Suche mit CentraXX

2020-02-05T13:27:13Z

Dbrucker: Die Kategorien wurden geändert.

zurück zum Hauptartikel [[CentraXX]]
==Grundlagen==

[[Datei:CentraXX_Patientensuche.jpg|upright|thumb|Die Patientensuche]]
Die '''Patientensuche''' wird über [Patient / Patientensuche gestartet]. Sie können sich die Patientensuche auch als Einstiegsseite in CentraXX in den Einstellungen hinterlegen.

===Suche mit Platzhaltern===
Grundsätzlich kann mit zwei '''Platzhaltern''' gesucht werden: 
'''*''': ersetzt beliebig viele Zeichen (z.B.: M*er findet Müller, Maier, Meier, ...) 
'''?''': ersetzt genau ein Zeichen (z.B.: M?ier findet Maier und Meier, nicht aber Müller) 

===Nummernkreise (Patienten ID)===
In CentraXX wird eine Vielzahl von Nummernkreisen eingesetzt. Diese bezeichnen einen Patienten oder eine Probe eindeutig. Jeder Patient (auch wenn er in CentraXX angelegt wurde) hat mindestens die eindeutige '''CentraXX-ID'''. Da CentraXX an verschiedenen Systemen angeschlossen ist, werden die identifizierenden Nummern aus diesen Systemen zusätzlich nach CentraXX übernommen. Ein am UCT dokumentierter Patient besitzt somit mindestens den '''MPI''' (Master Patient Index), dieser entspricht der '''PID''' in Orbis. Außerdem die '''GTDS-ID''', unter welcher der Patient in der Tumordokumentation geführt wird und die '''CentraXX-ID''' welcher der in CentraXX vergebene eindeutige Bezeichner ist. Das Zusammenführen eines Patienten in CentraXX aus den verschiedenen Systemen erfolgt anhand der PID von CentraXX automatisch. Diese und weitere IDs kann man in den Suchkriterien unter '''Patienten-ID''' auswählen. Patienten lassen sich auch über die '''Fallnummer''' suchen, welche in CentraXX '''Episoden ID''' genannt wird. Näheres dazu weiter unten bei den [[#Suchbeispiele|Suchbeispielen]].

===Erweiterte Suche=== 

[[Datei:Erweiterte Suche mit Klammern.jpg|thumb|left|Erweiterte Suche]]Über die "'''Erweiterte Suche'''" hat man die Möglichkeit nicht einzelne Patienten sondern '''Patientengruppen''' zu finden, die einer bestimmten '''Fragestellung''' entsprechen. Man hat dabei die Möglichkeit, die Suche als logische Suche mit Klammern aufzubauen:

*Über dem Eingabebereich der Suchabfrage wird im Feld "'''Suchkriterien'''" die Suchabfrage dargestellt. Dies dient insbesondere bei komplexen Abfragen mit Klammern und verschachtelten '''UND/ODER''' Bedingungen zur Kontrolle.
*Mit dem Plus [[Image:SYM_plus.png|without]] kann man das erste Kriterium hinzufügen.
*Das Plus mit Klammer [[image:SYM plus Klammer.png|without]] öffnet eine logische Klammer in der Suche. Diese wird durch einen umschließenden Kasten dargestellt.
*Die beiden Blätter [[Image: SYM_Duplizieren.png|without]] kopieren ein Suchkriterium in die nächste Zeile.
*Über den Papierkorb [[Image:SYM_Papierkorb.png|without]] kann man ein einzelnes Kriterium löschen.

Grundsätzlich können Bedingungen mit '''UND/ODER''' verknüpft werden. Außerdem können alle Bedingungen über die Auswahlbox vor dem Wertefeld mit '''"ungleich" verneint''' werden.

Über '''"Suchen"''' startet die Suche. Diese ist je nach Umfang nach wenigen Sekunden abgeschlossen.

Mit '''"Suche laden"''' kann eine selbst gespeicherte oder zentral zur Verfügung gestellte Suche geladen oder gelöscht werden. Außerdem gibt es in dem dann geöffneten Fenster die Möglichkeit, eigene Suchen anderen Benutzern oder gesamten Organisationseinheiten mit dem Symbol [[Image:SYM_Freigabe.png|without]] freizugeben. Die von '''anderen Benutzern zur Verfügung gestellten Suchen''' finden sich im unteren Bereich des Fensters.

Mit '''"Suche speichern"''' kann man selbst erstellte Suchen speichern. Falls Sie diese später anderen Benutzern zur Verfügung stellen möchten,kann man dies über '''"Suche laden"''' tun.

===Gestalten einer Suche mit mehreren Bedingungen===
Falls Sie mehrere Suchen miteinander verknüpfen müssen Sie beachten, dass die Reihenfolge der Suchbedingungen eine Rolle spielt. Dies gilt insbesondere bei Kombination mehrerer UND/ODER-Bedingungen. Eine Suche wird '''von "oben" nach "unten"''' abgearbeitet. Dabei werden gesetzte Klammern berücksichtigt. Sie müssen sich beim Entwurf der Suche bereits überlegen, welche Bedingungen sie miteinander in welcher Reihenfolge kombinieren, um zum gewünschten Ergebnis zu kommen.

===Wichtige Kriteriengruppen===
Die wichtigsten Kriteriengruppen für den Anfang sind folgende:

:'''ICD Codierung''': Hier kann die ICD-10, welche in der Tumordokumentation zum Patienten abgelegt ist, abgefragt werden
:'''Patient''': umfasst alle Stammdaten des Patienten (z.B. Alter, Geschlecht etc.)
:'''Probe''': Über [Probe – Probentyp – Flüssig/Gewebeprobe] kann auf das Vorhandensein einer Probe zum Patienten gesucht werden.
:'''Suchkatalog''': Der Suchkatalog erleichtert die Suche nach bestimmten Tumorerkrankungen, da die '''Kodierung bereits hinterlegt''' ist.
:'''Messwert (Befund)''': Mithilfe von Messbefunden können alle Merkmale, die über die Standard-Dokumentation hinausgehen (z.B. molekulare Marker oder Blutwerte), abgefragt werden.

==Suche mit dem Suchkatalog==

Da die korrekte Abfrage von Krankheiten mittels ICD-10 und ICD-O-3 oftmals eine Herausforderung darstellt, wurde in CentraXX die Möglichkeit implementiert, die wichtigsten Tumorentitäten auswählen zu können und ohne Angabe eines ICDs in der Applikation abzufragen. CentraXX erstellt mit Hilfe eines hinterlegten Katalogs dann die zutreffende SQL-Abfrage aus ICD-10 und ICD-O-3 zusammen und führt diese aus.

===Beispiel===

Alle Patienten, die ein '''Soft-Tissue-Ewing-Sarkom''' besitzen und '''über 18 Jahre''' alt sind.

Eine '''manuelle Abfrage''' müsste über folgende Entitäten als ODER-Suche mit einer UND-Suche über das Alter verknüpft werden:

[[Image:Manuell Ewing-Soft-Sissue-Sarkom.png|left|thumb|upright=1.9|Manuelle Suchabfrage nach Ewing-Soft-Tissue-Sarkom]]
{| class="wikitable"
! colspan="2" align="center" |ODER
!UND
|-
!ICD-10!!ICD-O-3 M!!Alter
|-
|C25.*|| rowspan="8" align="center" |9260-3, 9473-3
| rowspan="8" align="center" |18
|-
|C30.*
|-
|C31.*
|-
|C49.*
|-
|C51.*
|-
|C52
|-
|C71.*
|-
|C72.*
|}

'''Einfacher''' kann diese Abfrage über den '''Suchkatalog''' wie folgt abgebildet werden:

[Suchkatalog | Sarkome | Ewing-Sarkom: Soft Tissue Ewing Sarkom] '''UND''' [Patient | Alter | >18]
 
[[Image:Suchkatalog Ewing-Soft-Sissue-Sarkom.png|left|thumb|upright=1.9|Beispiel im Suchkatalog]]

 

==Suchergebnisse==
[[Datei:CentraXX Bsp C20 Probe erg.jpg|thumb|Ergebnis der Suche nach C20+Biomaterial]]
Die durch die Suche gewonnenen Ergebnisse dienen der Erleichterung der Planung eines Projektes. Es sollen damit keinesfalls Daten für ein wissenschaftliches Projekt im Rahmen einer Auswertung umgesetzt werden. '''Falls sich aus dem Suchergebnis ein Projekt generieren lässt, so soll dies als Projektskizze im [[Scientific_Board_des_UCT|Scientific Board]] des UCT eingereicht werden'''. Nur so erhalten Sie das notwendige '''Ethikvotum''' für die Verwendung der Daten.

Das Ergebnis teilt sich in zwei Hälften auf: in der '''oberen Hälfte''' werden Patienten angezeigt, die in einem '''Behandlungszusammenhang''' stehen. In der '''unteren Hälfte''' erscheinen alle anderen dokumentierten Tumorpatienten des UKF in '''pseudonymisierter Form'''.

===Spalten der Ergebnisliste===
Es gibt die Möglichkeit, die vorhandenen Spalten durch Weitere zu ergänzen, indem man den kleinen Dropdown-Pfeil ganz rechts in der Spaltenübersicht des Suchergebnisses drückt. Einige Spalten (mit dem a-z-Symbol) können außerdem sortiert werden. Zudem kann man die Spaltenbreite wie bei Excel verändern. In den persönlichen Einstellungen kann man außerdem die Standardansicht festlegen und '''zusätzliche Spalten''' dauerhaft anwählen.

===Verfeinern eines Suchergebnisses durch eine Suche auf das Ergebnis===
Es ist möglich, '''das Suchergebnis zu verfeinern''', also eine Suche auf das gewonnene Ergebnis anzuwenden. Dabei wird im Suchergebnis bei den Suchkriterien die Option '''Suchergebnis verfeinern''' ausgewählt. Daraufhin öffnet sich eine weitere "Erweiterte Suche", welche aber '''ausschließlich auf das Suchergebnis''' angewandt wird.
[[File:Suchergebnis verfeinern.png|Suchergebnis verfeinern|links|800x800px]]

==Suchbeispiele==
===Suche nach Fallnummern===
Neben der '''Patienten-ID (PID/MPI)''' kann auch nach der '''Fallnummer''' gesucht werden. Diese wird in CentraXX als '''"Episoden ID"''' oder '''"externe Episoden ID"''' bezeichnet. Sie sollte auf keinen Fall mit der '''"CentraXX-Episoden ID"''' verwechselt werden. Hiezu muss in der '''erweiterten Patientensuche''' nach [Episode | Episoden ID | ...] abgefragt werden.

===Suche mit ICD-10-Codes===
Die in ICD-10 verschlüsselte '''Erkrankung''' kann in der '''Erweiterten Patientensuche''' über [ICD-Code | ICD-10 Code | ...] abgefragt werden. Bei der Nutzung von ICD-Codes ist darauf zu achten, dass diese '''häufig mit Nachkommastellen''' codiert sind. Deswegen ist es ratsam, die '''ICD-Codes mit einem "*" abzuschließen''', außer man möchte ganz spezifisch nach einem ICD-Code suchen.

Beispiel: '''C92.* statt C92'''

===Suche nach Erstdiagnosen===
Um Patienten mit '''Erstdiagnose''' aus einem bestimmten Jahr abfragen zu können, kann in der '''Erweiterten Patientensuche''' über [Tumor | Diagnosedatum | ...] das Erstdiagnosedatum eingeschränkt werden. Falls der Patient mehrere Tumoren besitzt, sind mehrere Erstdiagnosedaten möglich.

===Stadienspezifische Suche (TNM)===
Die Suche nach TNM-Stadium ist vor allem in der Dermatologie komplizierter, da hier die Stadieneinteilung nicht nur I, II, III, IV umfasst sondern '''auch die Untergruppen a und b'''. Außerdem werden Studien in Römischen Ziffern codiert, was die Suche etwas erschwert. Dies hat folgendes Vorgehen zur Folge:

Eine Suche nach Stadium IIa und IIb lautet wie folgt:

[TNM | Stadium | II?] '''UND NICHT''' [TNM | Stadium | III]

da sonst Stadium IIa, IIb '''und''' III gefunden werden.

===Suche nach Histo-Grading===
Das Histologische Grading in CentraXX speist sich aus einem in GTDS geführten Katalog. Dieser hat momentan folgende Ausprägungen:
'''Umsetzung der Grading-Suche in CentraXX'''
{| class="wikitable"

!Grading aus GTDS!!Eingabe in CentraXX
|-
|0||0
|-
|B||B
|-
|B-Zellig||B-* (nicht 'B*'!)
|-
|G||G (nicht 'G*'!)
|-
|G1 (Gut differenziert)||G1*
|-
|G2 (Mäßig differenziert)||G2*
|-
|G3 (Schlecht differenziert)||G3*
|-
|G4 (Undifferenziert)||G4*
|-
|GX (Differenzierungsgrad oder Herkunft nicht zu bestimmen)||GX*
|-
|H||H
|-
|Is||Is
|-
|L||L
|-
|Low grade (G1/G2)||Low*
|-
|M||M
|-
|T||T
|-
|X||X
|}

Um das Grading G1-G4 abfragen zu können, muss somit '''G1*, G2*, G3* oder G4*''' bei einer Abfrage eingegeben werden. Ansonsten wird das Grading aufgrund der in der folgenden Klammer vermerkten Ausprägung nicht gefunden.

===Suche nach sonstigen Klassifikationen===
Weitere Klassifikationen wie z.B. das FIGO-Stadium werde wie folgt gesucht:

[Sonstige Klassifikation | Name | "FIGO*"]

Um dies mit einem Grading zu kombinieren, als UND-Suche anschließen:

[Sonstige Klassifikation | Stadium | "III"]

===Suche nach Messwerten===

Messbefunde ermöglichen die unkomplizierte Dokumentation von klinischen und wissenschaftlichen Merkmalen an Proben oder Patienten, welche über die ADT-Standarddokumentation hinaus gehen. Hierzu gehören z.B. die sogenannten '''"erweiterten Merkmale"''' aus der Tumordokumentation als auch z.B. '''Laborwerte''' aus dem Zentrallabor.
<gallery>
Messbefund-1.png| 1) Öffnen des Messwert-Dialogs mit dem [+]
Messbefund-2.png| 2) Auswahl des Befundtyps (Tumor-/Episoden-/Probenbefund)
Messbefund-3.png| 3) Auswahl der Messprofils (GTDS für Tumorbefunde)
Messbefund-4.png| 4) Auswahl des Messparameters
Messbefund-5.png| 3a)Auswahl des Messprofils SWISSLAB
</gallery>

===Suche nach einem Patienten mit Rektumkarzinom und asserviertem Biomaterial===

[ICD Codierung | ICD-10 Code | C20] '''UND''' [Probe | Probentyp | Gewebeprobe]

[[Datei:CentraXX Bsp C20 Probe.jpg|left|thumb|without|upright=1.9|Beispiel einer Suche nach C20]]
 

===Suche nach Histologie (ICD-O-3-M)===
In CentraXX kann neben der ICD-10-Codierung auch nach der '''Histologie''' eines Tumors gesucht werden. Diese wird in der ICD-O-3 codiert. Dabei ist Folgendes unbedingt zu beachten: '''Histologie-Codes''' der ICD-O-3-M werden normalerweise in 4 Stellen und einem folgenden Bindestrich mit einer weiteren Ziffer abgebildet, die die Malignität abbildet. '''In CentraXX fällt der Bindestrich weg!'''

'''Umsetzung der Histologie-Suche in CentraXX'''
{| class="wikitable"

!ICD-O-3-M!!Eingabe in CentraXX
|-
|9260-3||92603
|-
|9473-3||94733
|}

===Suche nach einer Systemtherapie===
In CentraXX kann neben dem Protokoll (z.B. Mono-Chemotherapie, Poly-Chemotherapie, Hormontherapie etc.) auch nach der Intention, dem Status nach Therapieende, den Nebenwirkungen und Anderem abgefragt werden. Häufig sind die Verwendeten Substanzen von besonderem Interesse.
'''Beispiel:''' Um nach einem Patienten mit Carboplatin/Etoposid zu suchen, muss folgende Suche in der Erweiterten Suche definiert werden:

[Systemtherapie | Beschreibung | gleich | '''*Carboplatin*'''] UND [Systemtherapie | Beschreibung | gleich | '''*Etoposid*''']

'''Wichtig sind hier wieder die Platzhalter (*), ohne die eine Suche nur zu unvollständigen Ergebnissen führen würde.'''

===Abfrage des Vitalstatus===
Häufig stellt sich die Frage, ob Patienten noch leben oder bereits verstorben sind. Dies kann man über die Erweiterte Suche wie folgt abfragen:

Patient '''lebt noch''': [Patient | Sterbedatum | '''leer''']

Patient '''verstorben''': [Patient | Sterbedatum | '''beliebig'''] oder [Patient | Sterbedatum | '''von-bis''']
[[Datei:Vitalstatussuche.png|left|thumb|without|upright=2.5|Beispiel einer Vitalstatusabfrage]]
[[Category:CentraXX]]

CentraXX

2020-02-05T13:27:02Z

Dbrucker: Kategorie hinzugefügt

'''Schnellzugriff:'''
[[CentraXX#CentraXX-Oberfl.C3.A4che| Die Oberfläche]] |[[ Suche mit CentraXX ]] |[[ Austausch von Patientenlisten]] |[[CentraXX#Ansprechpartner| Ansprechpartner]] | [[Einwilligungsmanagement]] | [[Probenverwaltung]] | [[Lagerverwaltung]]

'''CentraXX''' ist eine komplexe MS-SQL Datenbank der Firma Kairos <ref>https://www.kairos.de/produkte/centraxx-bio/</ref>(Bochum) mit '''Schnittstellen zu diversen klinischen Systemen''' am UKF. CentraXX dient wissenschaftlichen Zwecken und erleichtert die im Behandlungszusammenhang stehende Einsicht in klinische Daten wie z.B. des Klinischen Krebsregisters, welches von der '''Tumordokumentation am UCT'''<ref>https://www.uct-frankfurt.de/forschung/clinical-data.html</ref> gepflegt wird. Außerdem verknüpft CentraXX diese Daten mit Biomaterialinformationen der Sammlungen der iBDF (z.B. der '''UCT Biobank'''), macht diese abfragbar und ermöglicht die Verwaltung und Dokumentation von Biomaterialien.

==Allgemeines==
CentraXX ist von jedem Klinet-Rechner über die Adresse '''https://swamepbbapp1.intra.kgu.de:8443/centraxx/''' erreichbar. Zudem ist der Link auf der Internetseite des UCT (www.uct-frankfurt.de) unter [Über uns | Zentrale Bereiche | Biobank] hinterlegt.

===Registrierung===
Zugriff wird auf Antrag gewährt. Die notwendigen Unterlagen werden auf Anfrage bei Biobank-uct@kgu.de oder über die unten aufgeführten [[CentraXX#Ansprechpartner|Ansprechpartner]] herausgegeben.

===Rückmeldung erwünscht?===
Zur Fehlerbehebung, bei Verbesserungsvorschlägen oder Anmerkungen zur Plausibilität einer Abfrage steht die unten aufgeführte [[CentraXX#Ansprechpartner|CentraXX-Gruppe]] zur Verfügung. Diese nimmt auch Vorschläge zu komplexen Abfragen entgegen, berät über die Umsetzung und gibt Rückmeldung zu diesen. Zentraler Kontakt: '''Biobank-uct@kgu.de'''. Anfragen werden in der Regel zeitnah beantwortet. Je nach Umfang und Verfügbarkeit der Mitarbeiter kann dies aber länger als einen Tag dauern. In diesem Fall würde über den geplanten Umsetzungstermin Bescheid gegeben werden.

===Aktualität der Daten===
CentraXX wird über diverse Schnittstellen mit Informationen versorgt. Je nach Quellsystem stehen die Informationen aufgrund der Dokumentations- und Arbeitsabläufe mit Zeitversatz in CentraXX zur Verfügung:

*Biomaterialdaten, welche in CentraXX eingepflegt wurden (Hämatologie & Neuropathologie): sofort
*Stammdaten aus Orbis: wenige Minuten
*Biomaterialdaten aus der allgemeinen BioBank: einige Tage
*Daten aus der Tumordokumentation: drei Wochen nach Entlassung des Patienten

===Wissenswertes zum Datenschutz===

*Für die Zugangsdaten gelten ähnliche Regeln wie für den Zugang zu Orbis:
**Passwörter sollten eine Grundkomplexität aufweisen (mind. 6 Zeichen + mind. eine Ziffer).
**Das Passwort muss jährlich geändert werden.
**Userkonten sind personengebunden und dürfen nicht weitergegeben werden.
**Die Nutzung von CentraXX wird geloggt. Auf die Logs wird nur unter bestimmten Voraussetzungen zugegriffen (z.B. Manipulationsverdacht, widerrechtliche Aneignung von Informationen).
*Projektarbeit (Auswertungen) darf nur nach voriger Beantragung und Genehmigung durch das Scientific Board und ein vorhandenes Ethikvotum erfolgen. Dies gilt nicht für einfache Abfragen.
*In CentraXX ist die Möglichkeit zum Export von Datenlisten an verschiedenen Stellen gegeben. Hiervon sollte aufgrund des Risikos eines Zugriffs auf die exportierten Daten durch Unbefugte nur im Einzelfall Gebrauch gemacht werden, insbesondere wenn personenidentifizierenden Daten im Export inkludiert sind.
*'''Eine Weitergabe der Daten an Dritte ist untersagt und darf nur nach Rücksprache geschehen.'''

===Das Rollen- und Rechtekonzept in CentraXX===
CentraXX bietet die Möglichkeit, unter Wahrung des Datenschutzes Zugriff auf wissenschaftlich relevante Informationen zu gewähren. Dazu ist ein umfangreiches Rollen- und Rechtekonzept implementiert, welches den Zugriff auf Informationen in Abhängigkeit von Berufsgruppenzugehörigkeit und Arbeitsstätte gewährt. Für den Benutzer relevante Rollen sind wie folgt definiert:

{| class="wikitable" style="width: 80%; Margin: 1em auto 1em auto;" border="1"
|-
!Rolle
!Patient mit Klarnamen?
!Patient mit Pseudonym?
!Bioproben sichtbar?
|-
|'''Arzt'''
|Tumorpatienten der eigenen Abteilung
|Tumorpatienten am UKF
|Nur Stammprobe
|-
|'''Pathologe'''
|Tumorpatienten der eigenen Abteilung
|Tumorpatienten am UKF
|Proben der eigenen Pathologie
|-
|'''MTA'''
|Tumorpatienten der eigenen Abteilung
|Nein
|Proben der eigenen Pathologie
|-
|'''Scientist'''
|Nein
|Tumorpatienten mit Einwilligung
|Nur Stammprobe
|-
|} 

==CentraXX-Oberfläche==
Innerhalb des Klinets erreicht man die Datenbank unter der Webadresse '''https://swamepbbapp1.intra.kgu.de:8443/centraxx/'''. Ein Zugriff von außen ist nur über einen VPN-Zugang möglich. Dort kann man sich mit dem Benutzernamen (Schema 1. Buchstabe des Vornamens+Nachnamen) und dem zugeteilten Passwort einloggen. Beim ersten Einloggen sollte man das zugeteilte Passwort durch ein selbst gewähltes ersetzen. Dieses sollte aus mindestens '''6 Zeichen bestehen und eine Zahl''' beinhalten. Das Passwort hat eine '''Gültigkeit von einem Jahr'''. Man muss es vor Ablauf der Frist über das Benutzermenü [Ihr Username / Passwort ändern] ändern oder aber bei Ablauf der Frist bzw. bei Verlust des Passworts unter '''BioBank-uct@kgu.de''' neu beantragen.

===Zugang zur Hilfe in CentraXX===
Unter dem Menü [CentraXX | Über CentraXX | Benutzerhandbuch] steht ein umfangreiches PDF des Benutzerhandbuchs zur Verfügung. Das Handbuch ist eine sehr gute Informationsquelle für Fragen der Bedienung der Anwendung. Allerdings werden viele Module, die im Handbuch dargestellt sind, abhängig von der Benutzerberechtigung nicht aufrufbar sein. Für standortspezifische Themengebiete steht '''dieses Wiki''' zur Verfügung, welches als Dokumentation für die lokalen Besonderheiten dient. Es wird kontinuierlich weiterentwickelt und beruht auch auf den Rückmeldungen der Nutzer.

===Übersicht===
[[Datei:Übersicht.jpg|thumb|Übersichtsseite von CentraXX]]
In der Standardansicht für Ärzte haben folgende Menüs eine Funktion: Patient, Forschung, CentraXX und das persönliche Menü. Weitere Menüs werden je nach Rolle eingeblendet. Das Administrationsmenü kann nicht komplett ausgeblendet werden, hat aber für Benutzer keine Bedeutung. Eine Anpassung der Startansicht ist über die Einstellungen im persönlichen Menü möglich. So kann z.B. immer mit der Patientensuche oder dem Dashboard anstatt des leeren CentraXX-Bildschirms gestartet werden.

===Grundlegendes zur Bedienung von CentraXX 3.11===

:'''Doppelklick''': Wenn in einer Tabelle nur eine Bearbeitungsmöglichkeit besteht, wie z.B. im Bereich Codierung kann per Doppelklick auf den gewünschten Eintrag in der Tabelle der Bearbeitungsdialog direkt geöffnet werden.
:'''Einzelselektion/Mehrfachselektion''': In Tabellen wird ein einzelner Eintrag per Mausklick selektiert. Bei gedrückt gehaltener Strg-Taste können mehrere Einträge per Mausklick ausgewählt werden. Alternativ lassen sich bei gedrückt gehaltener Shift-Taste mehrere Einträge sequentiell markieren/auswählen.
:'''Freitextsuche''': Dropdown-Menüs, die analog zu Eingabefeldern gestaltet sind, können durch Eingabe von Freitext nach Inhalten durchsucht werden. Wenn die Suche ein Ergebnis anzeigt, kann dieses über Betätigen der Enter-Taste ausgewählt werden.
:'''Gelbe Felder sind Pflicht''': Gelb hinterlegte Felder eines Dialogs müssen ausgefüllt sein, bevor dieser abgeschlossen werden kann.
:'''Konfigurierbare Spalten''': Die Anzeige von Tabellenspalten in Ergebnislisten nach Suchen ist konfigurierbar. Dies ist pro Session dort möglich, wo an der rechten Spalte folgendes Symbol erscheint ([[Datei:SYM konfigurierbare Spalten.png]]). Jeder Benutzer kann unter „Einstellungen“ permanente Spaltenkonfiguration für sein Konto vornehmen (siehe Einstellungen).
:'''Minimierte Ansicht''': Wird zwischen Menüpunkten gewechselt, werden minimierte Ansichten zu den verlassenen Modulen im unteren Bildbereich erzeugt. Wird über diese Ansichten zurück navigiert, werden die Module so aufgerufen, wie sie verlassen wurden. Dem Anwender wird mit den minimierten Ansichten ein Überblick über die in der laufenden Session besuchten Module geboten. Unter Einstellungen kann angegeben werden, ob das System immer einen Hinweis geben soll, wenn eine Ansicht minimiert wird.
:'''Selektion vor Bearbeitung''': Einträge in Listen/Tabellen (z.B. ein Patient oder eine Probe) müssen per Mausklick selektiert werden (erscheinen danach blau hinterlegt), bevor die gewünschte Funktion (z.B. Einlagerung) gestartet/auf den selektierten Eintrag angewendet werden kann.
:'''Verbreitern/Verschmälern von Tabellen''': In tabellarischen Übersichten lassen sich einzelne Spalten verbreitern oder verschmälern. Dazu fahren Sie mit der Maus über die Spaltenbegrenzung in der Kopfzeile (es erscheint das folgende Symbol:[[Image:SYM_Doppelpfeil.png|without]] ). Mit gedrückter linker Maustaste können Sie nun die Spalte breiter oder schmaler ziehen.
:'''Vergrößern/Verkleinern von Dialogen''': Jedes Dialog-Fenster, das unten rechts dieses Symbol ([[Image:SYM_vergroessern.png|without]]) aufweist, lässt sich mit Klick auf das Symbol und gedrückt gehaltener linker Maustaste größer oder kleiner ziehen.

===Das persönliche Menü (ganz rechts)===

Im '''persönlichen Menü''' kann man Nutzer-spezifische Einstellungen hinterlegen und aufrufen.

:'''Dashboard''': Auf dem Dashboard kann man z.B. die Patientensuchen der letzten Tage für den schnellen Zugriff anzeigen lassen.
:'''Meine Suchabfragen''': Unter diesem Menüpunkt kann man auf gespeicherte Suchen zurückgreifen und diese direkt aufrufen.
:'''Sprache''': CentraXX ist zweisprachig ausgelegt. Man kann zwischen einer deutschsprachigen und einer englischsprachigen Oberfläche wählen.
:'''Passwort ändern''': Ändert das Passwort. Es hat ab Änderung eine Gültigkeit von einem Jahr.
:'''Einstellungen''': Im Einstellungsbereich kann man die Anwendung an Ihre persönlichen Bedürfnisse anpassen. So z.B. die sichtbaren Tabellenspalten in diversen Listen.
:'''Abmelden''': Aus Sicherheitsgründen sollte man sich wie in Orbis nach Beendigung der Nutzung '''abmelden'''.

===Das Menü CentraXX===
In diesem Menü findet sich der Bereich '''Aufgaben'''. In diesem kann man sich selbst Aufgaben hinterlegen. Außerdem dient er als '''Schnittstelle zwischen dem Benutzer und dem BioBank-Projektmanagement''', über welche Patientenlisten ausgetauscht werden können. Dies ist zum Beispiel notwendig, wenn aus einer Patientenliste eine Subgruppe für eine Biomaterialanforderung übergeben werden soll. Dabei wird die Pseudonymisierung immer an die Rechte des Empfängers der Aufgabe angepasst. Unter dem Artikel [[Austausch von Patientenlisten|'''"Biomaterial und das Management von Patientenlisten"''']] finden sich vertiefende Informationen.

Hier kann man außerdem das '''Benutzerhandbuch''' von CentraXX aufrufen. Bitte Fehler nicht direkt an die Firma sondern an [[CentraXX#Ansprechpartner|uns]] melden, da wir diese über ein Ticketsystem koordinieren.

===Das Menü Forschung===
Im Bereich Statistik werden '''programmierte Abfragen (Reports)''' angezeigt, die für die allgemeine Verwendung oder einzelne User freigegeben wurden.

===Das Menü Patient===
Dies ist '''das wichtigste Menü''' für den Anwender. Eine Patientensuche wird hier gestartet. Alle freigegebenen Informationen zu einem gefundenen Patienten werden in der elektronischen Patientenakte (EPA) zusammengefasst.

==CentraXX-Suchen==
[[Datei:Erweiterte_Suche_mit_Klammern.jpg|thumb|Erweiterte Suche]]
Um die großen Datenbestände in CentraXX für den Anwender abfragbar zu machen, stellt die Applikation ein '''umfangreiches Suchformular''' zur Verfügung. Dieses generiert im Hintergrund SQL-Abfragen, die auf die Datenbank zugreifen. Im Anschluss werden die Ergebnisse in Form von Listen datenschutzkonform angezeigt. Aus diesen können Merklisten erstellt werden, die dem Projektmanagement der Biobank des UCT in der Applikation übergeben werden. Außerdem gibt es die Möglichkeit Suchen für die spätere Wiederbenutzung im eigenen Benutzerkonto abzuspeichern. Zudem können vordefinierte Suchen global oder einzelnen Benutzergruppen zur Verfügung gestellt werden.

Um die komplexe Abfrage von Tumorentitäten über ICD-O-3 und ICD-10 zu erleichtern, wurde ein '''[[Suche mit CentraXX#Suche mit dem Suchkatalog|Suchkatalog]]''' implementiert, welcher die Abfrage kompletter Code-Bereiche auf einen Mausklick reduzieren kann.
Weiterführende Informationen zur Suchfunktion sind unter dem Unterartikel '''[[Suche mit CentraXX]]''' zu finden. Da die Gestaltung der Suche nicht trivial ist, wird das Studium dieses Kapitels allen Benutzern '''dringend empfohlen'''.

==Ansprechpartner==

{| class="wikitable" border="1"
|-
!Bereich
!Wer
!E-Mail
!Tel.
!FAX
|-
|Projektleitung UCT & Biobank
|[[Benutzer:Dbrucker|D. Brucker]]
|Daniel.Brucker@kgu.de
|87186
|3968
|-
|Projektleitung DICT
|A. Ahmadi
|Azita.Ahmadi@kgu.de
|83997
|3770
|-
|Projektskizzen (Material & Daten)
|K. Götze
|Kristina.Goetze@kgu.de
|87187
|3968
|-
|Leitung Tumordokumentation
|G. Husmann
|Gabriele.Husmann@kgu.de
|3935
|3968
|-
|Bug Reports & SQL-Entwicklung
|T. Schneider
|Timo.Schneider@kgu.de
|1791888
|3968
|-
|Studien
|S. Hehn
|s.hehn@med.uni-frankfurt.de
|6429
|7463
|-
|}
<references />
[[Kategorie:CentraXX]]

APProVe Projektskizzenverwaltung

2020-01-28T10:51:20Z

Dbrucker:

CentraXX

2020-01-27T13:18:39Z

Dbrucker: