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Aktuelle Version vom 30. September 2022, 15:29 Uhr
- Tools für CentraXX
Im Folgenden werden die selbst-erarbeiteten Tools für CentraXX vorghestellt und erläutert, wie diese zu bedienen sind.
CentraXX-Excel-Filler aka Annotation der PID an Patientenliste
ORT: U:\Projekte\Centraxx\centraxx_excel_filler
Bei diesem Tool handelt es sich um eine Annotation einer vorhandenen Excel Liste.
Falls Sie eine Excel-Liste mit Patienten haben, versucht dieses Tool alle ID's der Patient:innen zu suchen.
Benötigt werden die folgenden drei Felder mit je einer Spalte:
- Vorname
- Nachname
- Geburtsdatum
- Name der xlsx-Datei
Die folgenden Dateien werden dazu benötigt:
- centraxx_excel_filler.properties
- centraxx-excel-filler-fat-1.0-SNAPSHOT.jar
- Eine xlsx-Datei die annotiert werden soll (KEINE XLS DATEI!)
Anleitung
Befüllen der .properties Datei
| Variablenname | Beschreibung |
|---|---|
| excel.path | Dateiname mit Dateiendung (zB Biobank.xlsx) |
| mapping.first-name | Spaltenname in dem der Vorname steht (zB Patientenvorname) |
| mapping.last-name | Spaltenname in dem der Nachname steht (zB Patientennachname) |
| mapping.birthday | Spaltenname des Geburtsdatums (Tagesaktuell) |
| database.url | Url der Datenbank (in unserem Fall für Produtiv): swamepbbdb1.intra.kgu.de:1433 |
Ausführen der .jar-Datei
Klicken Sie zum ausführen der .jar-Datei in das Adressfeld und markieren Sie den kompletten Pfad.
Anstelle des Pfades können Sie nun
cmd
einfügen.
Anschließend öffnet sich die Kommandozeile im aktuellen Ordner.
Führen Sie diesen Befehl aus, nachdem Sie die .properties-Datei befüllt haben.
java -jar centraxx-excel-filler-fat-1.0-SNAPSHOT.jar --database-user <USERNAME> --database-password <PASSWORD>
Für <USERNAME> und <PASSWORD> tragen Sie bitte die entsprechenden Daten ein.
Nachdem das Skript durchgelaufen ist, sollte im gleichen Ordner eine neue Datei erstellt worden sein, mit den annotierten Daten.
Anmerkungen
Die Suche liefert keine Ergebnisse sollte die Person nicht eindeutig in CentraXX bestimmbar sein. Zum Beispiel, wenn sie den selben Namen und das gleiche Geburtsdatum haben.
Sollte die Person in CentraXX nicht gefunden werden, wird auch keine ID ausgegeben
Proben umhängen
TODO
