CentraXX - Eigene Tools

1. Tools für CentraXX

Im Folgenden werden die selbst-erarbeiteten Tools für CentraXX vorghestellt und erläutert, wie diese zu bedienen sind.

CentraXX-Excel-Filler aka Annotation der PID an Patientenliste

ORT: U:\Projekte\Centraxx\centraxx_excel_filler

Bei diesem Tool handelt es sich um eine Annotation einer vorhandenen Excel Liste.

Falls Sie eine Excel-Liste mit Patienten haben, versucht dieses Tool alle ID's der Patient:innen zu suchen.

Benötigt werden die folgenden drei Felder mit je einer Spalte:

1. Vorname
2. Nachname
3. Geburtsdatum
4. Name der xlsx-Datei

Die folgenden Dateien werden dazu benötigt:

1. centraxx_excel_filler.properties
2. centraxx-excel-filler-fat-1.0-SNAPSHOT.jar
3. Eine xlsx-Datei die annotiert werden soll (KEINE XLS DATEI!)

Anleitung

Befüllen der .properties Datei

Variablenname	Beschreibung
excel.path	Dateiname mit Dateiendung (zB Biobank.xlsx)
mapping.first-name	Spaltenname in dem der Vorname steht (zB Patientenvorname)
mapping.last-name	Spaltenname in dem der Nachname steht (zB Patientennachname)
mapping.birthday	Spaltenname des Geburtsdatums (Tagesaktuell)
database.url	Url der Datenbank (in unserem Fall für Produtiv): swamepbbdb1.intra.kgu.de:1433

Ausführen der .jar-Datei

Klicken Sie zum ausführen der .jar-Datei in das Adressfeld und markieren Sie den kompletten Pfad.

Markieren des Pfades

Anstelle des Pfades können Sie nun

cmd

einfügen.

Anschließend öffnet sich die Kommandozeile im aktuellen Ordner.

Führen Sie diesen Befehl aus, nachdem Sie die .properties-Datei befüllt haben.

java -jar centraxx-excel-filler-fat-1.0-SNAPSHOT.jar --database-user <USERNAME> --database-password <PASSWORD>

Für <USERNAME> und <PASSWORD> tragen Sie bitte die entsprechenden Daten ein.

Nachdem das Skript durchgelaufen ist, sollte im gleichen Ordner eine neue Datei erstellt worden sein, mit den annotierten Daten.

Proben umhängen

TODO